55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0755 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 398 aa  786    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  48.77 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  43.47 
 
 		 411 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  39.18 
 
 		 407 aa  282  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  35.97 
 
 		 415 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  35.25 
 
 		 421 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  37.92 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  36.99 
 
 		 410 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  43.3 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.89 
 
 		 540 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  33.9 
 
 		 536 aa  245  9e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.61 
 
 		 521 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  34.02 
 
 		 491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  35.62 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  32.52 
 
 		 517 aa  232  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  31.69 
 
 		 532 aa  231  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  35.48 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  33.66 
 
 		 485 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  33.11 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  32.72 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  31.87 
 
 		 391 aa  193  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  32.98 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  31.27 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  28.57 
 
 		 517 aa  176  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.18 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  27.27 
 
 		 434 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  33.78 
 
 		 270 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  34.93 
 
 		 270 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  32.81 
 
 		 416 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  37.3 
 
 		 140 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  34.33 
 
 		 148 aa  87  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  24.56 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.19 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1338  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.43 
 
 		 241 aa  47  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.164705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  23.4 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0359  sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  25.22 
 
 		 458 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0492  hypothetical protein  27.66 
 
 		 238 aa  46.6  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.2 
 
 		 1079 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0398  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.19 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0161377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0397  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.19 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000185602  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.11 
 
 		 202 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 615 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3627  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.19 
 
 		 248 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 617 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1659  flavoprotein  25 
 
 		 227 aa  44.3  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4817  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29.77 
 
 		 220 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29.77 
 
 		 220 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4677  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29.77 
 
 		 220 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4762  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29.77 
 
 		 220 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  25.42 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0379  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.82 
 
 		 220 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000130602  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5064  hemerythrin HHE cation binding region  29.85 
 
 		 141 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650384  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5056  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  25.15 
 
 		 225 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4688  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.77 
 
 		 220 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.041656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>