100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0397 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0397  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
248 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000185602  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0398  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  99.19 
 
 
248 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0161377  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3627  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  99.19 
 
 
248 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4302  hypothetical protein  91.44 
 
 
222 aa  430  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3576  hypothetical protein  80.24 
 
 
259 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.421101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3890  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  81.28 
 
 
269 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188883 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4083  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  81.28 
 
 
269 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0155994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3989  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  80.85 
 
 
269 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3967  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  80.85 
 
 
269 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0492  hypothetical protein  72.89 
 
 
238 aa  360  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0328  hypothetical protein  71.07 
 
 
238 aa  360  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0203423  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3236  hypothetical protein  72.44 
 
 
234 aa  359  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4124  hypothetical protein  73.66 
 
 
236 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0383  hypothetical protein  63.95 
 
 
240 aa  314  8e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0450  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  60.25 
 
 
177 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1338  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  43.42 
 
 
241 aa  206  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.164705  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2414  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.61 
 
 
243 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597571  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4057  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.65 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4649  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  41.3 
 
 
236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  0.343196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5785  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  41.07 
 
 
312 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1827  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  41.48 
 
 
242 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.467017 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0365  protein of unknown function DUF542, ScdA-like  41.18 
 
 
242 aa  165  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.65621  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1251  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.9 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.964193  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  37.39 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3032  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  37.1 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0698  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.21 
 
 
318 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249196  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0849  hypothetical protein  38.43 
 
 
249 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0199  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  37.55 
 
 
236 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0782  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  37.33 
 
 
221 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0196066  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3700  hypothetical protein  36.84 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2769  protein of unknown function DUF542, ScdA-like protein  37 
 
 
251 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.381543  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0815  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  38.22 
 
 
222 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0339092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3494  hemerythrin HHE cation binding region  36.28 
 
 
249 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2293  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  35.17 
 
 
238 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00571035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2153  ScdA protein  35.81 
 
 
235 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1950  cell division and morphogenesis-related protein  34.93 
 
 
235 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0219264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1998  ScdA protein  34.93 
 
 
235 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00228936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2147  ScdA protein  34.93 
 
 
235 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.910173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2178  ScdA protein  34.93 
 
 
235 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0432  hypothetical protein  36.29 
 
 
236 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0203257  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3955  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  38.05 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1971  cell division and morphogenesis-related protein  34.5 
 
 
235 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0041532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2294  ScdA protein  34.06 
 
 
235 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.208436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1582  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  36.2 
 
 
235 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  37.61 
 
 
221 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3632  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  37.61 
 
 
221 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1991  hypothetical protein  34.5 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3584  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  35.56 
 
 
221 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000456078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3427  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  35.56 
 
 
221 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0534408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04044  hypothetical protein  35.27 
 
 
220 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4750  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  35.27 
 
 
220 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.020864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  35.27 
 
 
220 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000715657  normal  0.850161 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3784  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  35.27 
 
 
220 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0015085  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  35.27 
 
 
220 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00129664  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4463  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  35.27 
 
 
220 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00510158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04081  predicted regulator of cell morphogenesis and cell wall metabolism  35.27 
 
 
220 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00617951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3161  ScdA protein  34.51 
 
 
235 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.284126  normal  0.196192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4688  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34.82 
 
 
220 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.041656  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5726  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  35.27 
 
 
220 aa  141  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0664368  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1188  protein of unknown function DUF542, ScdA-like protein  36.04 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0379  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34.68 
 
 
220 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000130602  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4667  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34.38 
 
 
220 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4762  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34.38 
 
 
220 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4817  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34.38 
 
 
220 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34.38 
 
 
220 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4677  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34.38 
 
 
220 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1168  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  33.33 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104641  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02289  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  33.92 
 
 
223 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104095 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0730  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  34.84 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2035  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34.35 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1686  hypothetical protein  33.77 
 
 
231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3164  hypothetical protein  33.76 
 
 
240 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2511  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.76 
 
 
240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3025  hypothetical protein  36.52 
 
 
223 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1841  hypothetical protein  35.29 
 
 
242 aa  125  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3578  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  33.48 
 
 
223 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4655  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  33.48 
 
 
223 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84876  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1571  hypothetical protein  36.76 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0611813  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1742  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  30.67 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0584287  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0324  cell wall biosynthesis protein ScdA  29.15 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.896  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03871  regulator of cell morphogenesis and NO signaling  35.16 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1824  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  30.22 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2133  hemerythrin HHE cation binding protein  30.22 
 
 
231 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5056  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  33.81 
 
 
225 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4224  hypothetical protein  33.48 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2399  hypothetical protein  32.6 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0283392  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0244  cell wall biosynthesis protein ScdA  29.86 
 
 
224 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0250  cell wall biosynthesis protein ScdA  29.86 
 
 
224 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.887141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0600  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.57 
 
 
162 aa  89.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000823613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2304  putative regulator of cell morphogenesis and NO signaling  36 
 
 
162 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.904148  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0753  scdA protein, putative  30.7 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00120988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0777  putative scdA protein  31.16 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000142333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3857  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.76 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0691  hypothetical protein  26.25 
 
 
247 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0574  hypothetical protein  23.91 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.157203 
 
 
-
 
NC_002950  PG1236  hypothetical protein  21.92 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.19 
 
 
398 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.45 
 
 
177 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.17 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.87 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>