19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1659 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1659  flavoprotein  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  44.97 
 
 		 411 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  43.09 
 
 		 403 aa  137  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1806  oxidoreductase, putative, truncated  40.32 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1653  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.001552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  30.25 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  27.32 
 
 		 406 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  29.55 
 
 		 321 aa  49.7  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  25.17 
 
 		 416 aa  48.9  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  24.03 
 
 		 148 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  22.46 
 
 		 322 aa  46.6  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.52 
 
 		 342 aa  45.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  27.48 
 
 		 432 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  26.67 
 
 		 433 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25 
 
 		 398 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  23.97 
 
 		 395 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  26.15 
 
 		 434 aa  42.7  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  27.69 
 
 		 536 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  24.16 
 
 		 391 aa  42  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>