12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1806 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1806  oxidoreductase, putative, truncated  100 
 
 		 241 aa  508  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  76.75 
 
 		 403 aa  377  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  75.88 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1659  flavoprotein  40.32 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1653  hypothetical protein  24.2 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.001552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  20.9 
 
 		 416 aa  49.3  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  24.41 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  24.81 
 
 		 407 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0413  hypothetical protein  43.14 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000247794  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  21.97 
 
 		 517 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.62 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  23.16 
 
 		 322 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>