94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0644 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0644  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0540677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3492  hypothetical protein  33.2 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0279106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4950  hypothetical protein  33.48 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5681  hypothetical protein  33.19 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5276  hypothetical protein  33.19 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.348652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5006  hypothetical protein  33.19 
 
 
268 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4850  hypothetical protein  33.19 
 
 
268 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5386  hypothetical protein  33.19 
 
 
268 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4835  hypothetical protein  33.19 
 
 
268 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5242  hypothetical protein  33.19 
 
 
268 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5318  hypothetical protein  33.19 
 
 
268 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5261  hypothetical protein  33.19 
 
 
268 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0149  protein of unknown function DUF368  30.67 
 
 
332 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2147  hypothetical protein  29.83 
 
 
294 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1029  hypothetical protein  35.15 
 
 
279 aa  105  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04844  hypothetical protein  33.06 
 
 
305 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1858  hypothetical protein  29.83 
 
 
341 aa  105  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.685833 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0693  hypothetical protein  29.96 
 
 
309 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1206  hypothetical protein  32.65 
 
 
304 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0784  hypothetical protein  31.84 
 
 
262 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0036  membrane protein  31.3 
 
 
306 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0888  protein of unknown function DUF368  33.59 
 
 
286 aa  102  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0761  hypothetical protein  32.29 
 
 
253 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001101  membrane protein  31.58 
 
 
293 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1400  hypothetical protein  32.65 
 
 
292 aa  102  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3873  hypothetical protein  32.91 
 
 
330 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2796  hypothetical protein  30.74 
 
 
304 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0930  hypothetical protein  32.49 
 
 
305 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0495  hypothetical protein  31.18 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.322978  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3082  hypothetical protein  31.43 
 
 
304 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2879  hypothetical protein  31.43 
 
 
304 aa  99  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2975  hypothetical protein  31.43 
 
 
304 aa  99  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2250  hypothetical protein  33.91 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3073  hypothetical protein  31.43 
 
 
304 aa  98.6  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0094  hypothetical protein  30.54 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000305828  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3225  hypothetical protein  31.43 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0838  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1873  protein of unknown function DUF368  33.05 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000015734  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1294  protein of unknown function DUF368  31.43 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3700  hypothetical protein  34.78 
 
 
268 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.435623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0943  hypothetical protein  32.07 
 
 
330 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0196129  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1251  membrane protein  28.39 
 
 
314 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06740  integral membrane protein  30.21 
 
 
307 aa  96.3  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3022  hypothetical protein  28.81 
 
 
312 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1306  hypothetical protein  28.11 
 
 
309 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2001  hypothetical protein  28.15 
 
 
324 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651043 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1811  protein of unknown function DUF368  29.06 
 
 
317 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3040  hypothetical protein  30.99 
 
 
309 aa  92.8  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0387  protein of unknown function DUF368  24.69 
 
 
320 aa  92.4  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0858  hypothetical protein  30.48 
 
 
283 aa  92  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0156  protein of unknown function DUF368  24.15 
 
 
297 aa  92  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0842  hypothetical protein  30.48 
 
 
283 aa  92  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0142899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0960  hypothetical protein  28.63 
 
 
316 aa  89.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0717  hypothetical protein  32.79 
 
 
282 aa  89  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18913  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2783  hypothetical protein  28.69 
 
 
307 aa  88.6  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2633  hypothetical protein  27 
 
 
313 aa  88.6  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0928  hypothetical protein  27.98 
 
 
329 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3862  hypothetical protein  26.07 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2358  protein of unknown function DUF368  34.98 
 
 
286 aa  86.7  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115253  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1370  hypothetical protein  31.08 
 
 
303 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1038  hypothetical protein  31.06 
 
 
310 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.246357  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  27.76 
 
 
565 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0809  hypothetical protein  29.96 
 
 
284 aa  86.3  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0473658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1628  hypothetical protein  31.08 
 
 
301 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0446  hypothetical protein  28.27 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1638  hypothetical protein  28.46 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2840  hypothetical protein  28.81 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1472  hypothetical protein  27.73 
 
 
278 aa  82  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.248471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1107  hypothetical protein  30.71 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0703  protein of unknown function DUF368  25.42 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.339954  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0787  hypothetical protein  34.18 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2007  hypothetical protein  25.21 
 
 
337 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00601803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2510  hypothetical protein  29.13 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000712046  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24370  predicted membrane protein  23.98 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0288  protein of unknown function DUF368  24.81 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20100  predicted membrane protein  25.2 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00191645  normal  0.0169787 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0704  hypothetical protein  25.55 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.527193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0607  protein of unknown function DUF368  24.1 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1575  protein of unknown function DUF368  26.89 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2501  protein of unknown function DUF368  27.53 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2809  protein of unknown function DUF368  26.95 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2249  hypothetical protein  23.97 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5992  protein of unknown function DUF368  27.85 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2958  protein of unknown function DUF368  29.67 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1640  hypothetical protein  28.69 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1921  protein of unknown function DUF368  23.81 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1718  hypothetical protein  25.1 
 
 
297 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1061  protein of unknown function DUF368  23.69 
 
 
314 aa  63.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3629  protein of unknown function DUF368  24.61 
 
 
318 aa  62.4  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0187  protein of unknown function DUF368  28.1 
 
 
289 aa  62  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06735  Predicted membrane protein  24.43 
 
 
342 aa  57  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260385  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1510  protein of unknown function DUF368  25.64 
 
 
301 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2829  protein of unknown function DUF368  26.52 
 
 
320 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2720  membrane protein-like protein  31.03 
 
 
183 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>