More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0334 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0334  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
196 aa  380  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1869  alkaline phosphatase  54.88 
 
 
200 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0736  alkaline phosphatase  50.3 
 
 
201 aa  149  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  40.11 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  36.17 
 
 
216 aa  133  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  42.17 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  36.32 
 
 
198 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  36.32 
 
 
202 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  35.26 
 
 
202 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.99 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  35.93 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  39.46 
 
 
199 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  35.94 
 
 
200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  38.27 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  31.02 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  34.01 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  30.77 
 
 
209 aa  109  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  35.33 
 
 
211 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  33.15 
 
 
216 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  31.35 
 
 
198 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  34.24 
 
 
219 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  34.91 
 
 
219 aa  106  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.11 
 
 
205 aa  105  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  35.6 
 
 
203 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  32.54 
 
 
218 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  32.43 
 
 
220 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  36.36 
 
 
228 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  33.85 
 
 
205 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  34.34 
 
 
325 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  35.08 
 
 
208 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  32.96 
 
 
199 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.28 
 
 
228 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  32.32 
 
 
208 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 
224 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  33.94 
 
 
202 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.59 
 
 
241 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.56 
 
 
218 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  31.94 
 
 
202 aa  100  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  31.75 
 
 
205 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.82 
 
 
219 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  33.51 
 
 
210 aa  99  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  37.43 
 
 
241 aa  99  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  37.21 
 
 
217 aa  99  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  31.58 
 
 
200 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  30.72 
 
 
201 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  28.86 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  31.05 
 
 
200 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  31.91 
 
 
200 aa  98.2  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 
218 aa  98.2  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  36.2 
 
 
206 aa  98.2  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 
218 aa  98.2  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  31.05 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  33.91 
 
 
198 aa  97.8  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  29.47 
 
 
203 aa  97.8  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.21 
 
 
202 aa  97.8  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  30 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  29.47 
 
 
203 aa  97.8  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  34.72 
 
 
225 aa  97.8  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  28.42 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.54 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  31.05 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  31.05 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  31.05 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  31.05 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  31.05 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  30.77 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18131  DedA family alkaline phosphatase-like protein  32.84 
 
 
219 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00672405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  30.11 
 
 
200 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  29 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  29.41 
 
 
197 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  37.42 
 
 
202 aa  95.5  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  30.53 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  35.26 
 
 
224 aa  95.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  27.56 
 
 
197 aa  94.7  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  30.54 
 
 
201 aa  94.7  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  28.88 
 
 
197 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  29.27 
 
 
203 aa  94  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.82 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  29.55 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  93.2  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.76 
 
 
206 aa  92  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  34.94 
 
 
206 aa  92  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  33.58 
 
 
219 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  29.44 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  30.73 
 
 
215 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  29.94 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  35.71 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  31.41 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  34.69 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  28.14 
 
 
202 aa  89.4  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  31.09 
 
 
266 aa  89  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  32.72 
 
 
202 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  29.94 
 
 
204 aa  88.6  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  29.94 
 
 
212 aa  88.6  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  29.45 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  28.83 
 
 
201 aa  88.2  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  28.83 
 
 
201 aa  88.2  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>