More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1496 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1496  FMNH2-dependent monooxygenase  100 
 
 
417 aa  842    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093324  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03239  thermophilic desulfurizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01010)  58.57 
 
 
364 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.657746  normal  0.586431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3463  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  45.36 
 
 
400 aa  284  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6564  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  44.47 
 
 
402 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.82838  normal  0.227478 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  42.71 
 
 
401 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0894  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.84 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0403335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0888  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  41.09 
 
 
396 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.09 
 
 
396 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6149  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  42.75 
 
 
402 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176892  hitchhiker  0.003301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.07 
 
 
409 aa  259  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  39.6 
 
 
448 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.32 
 
 
395 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.66 
 
 
395 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34200  putative FMNH2-dependent monooxygenase  37.97 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.911533  normal  0.0321853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31350  DszC-like desulfurization enzyme  39.01 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2907  putative FMNH2-dependent monooxygenase  37.97 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2772  monooxygenase, putative  37.38 
 
 
395 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1128  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.73 
 
 
404 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0557  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.97 
 
 
395 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2981  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.13 
 
 
395 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43890  Acyl-CoA dehydrogenase-related protein  38.16 
 
 
395 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1870  monoxygenase  39.06 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0453  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.8 
 
 
391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0550  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.54 
 
 
391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171714  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.44 
 
 
403 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0855  putative monooxygenase  35.71 
 
 
400 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110147  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4541  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  36.84 
 
 
400 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213669  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3032  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  38.44 
 
 
403 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210165  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.44 
 
 
403 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2083  monoxygenase  38.8 
 
 
423 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0983  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.29 
 
 
375 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5213  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.95 
 
 
403 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.174771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  36.22 
 
 
390 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4684  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.67 
 
 
403 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1247  putative monooxygenase  35.23 
 
 
394 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.791276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1773  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.96 
 
 
393 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1436  monoxygenase  38.02 
 
 
416 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3396  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.44 
 
 
403 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323455  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0862  monoxygenase  38.02 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2178  monoxygenase  38.02 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0314  Acyl-CoA dehydrogenase-like  36.68 
 
 
403 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0761  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.95 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0958645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44510  Acyl-CoA dehydrogenase/oxydase  33.69 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.5 
 
 
399 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  34.59 
 
 
401 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.16 
 
 
403 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  32.2 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.81 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  33.16 
 
 
401 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.52 
 
 
434 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.7 
 
 
393 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  31.88 
 
 
406 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  29.53 
 
 
422 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  33.25 
 
 
412 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.14 
 
 
393 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.25 
 
 
412 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.88 
 
 
393 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33 
 
 
412 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  30.81 
 
 
420 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.87 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  31.73 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  31.54 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.25 
 
 
413 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  32.49 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.66 
 
 
407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.68 
 
 
451 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.68 
 
 
412 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.68 
 
 
412 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.68 
 
 
412 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  31.89 
 
 
440 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.78 
 
 
412 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.68 
 
 
412 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.68 
 
 
412 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.83 
 
 
416 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  31.98 
 
 
405 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.22 
 
 
397 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32 
 
 
405 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.79 
 
 
413 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  32.36 
 
 
414 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.36 
 
 
410 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  30.4 
 
 
440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3173  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.36 
 
 
415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203103  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.54 
 
 
417 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  33.15 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  30.81 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.86 
 
 
410 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.55 
 
 
392 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.53 
 
 
413 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  31.39 
 
 
402 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.81 
 
 
404 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.81 
 
 
400 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.74 
 
 
413 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.81 
 
 
400 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.81 
 
 
404 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.81 
 
 
404 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  29.77 
 
 
413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.77 
 
 
413 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.54 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  29.51 
 
 
411 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.39 
 
 
415 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>