33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3228 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3228  putative lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 482 aa  983    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.903486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  55.3 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2769  putative lipid-A-disaccharide synthase  55.97 
 
 		 416 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  53.39 
 
 		 413 aa  488  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2729  hypothetical protein  53.94 
 
 		 423 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3384  putative lipid-A-disaccharide synthase  53.94 
 
 		 423 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0261  putative lipid-A-disaccharide synthase  50.81 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.504944  normal  0.0423311 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1378  hypothetical protein  46.2 
 
 		 413 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00681  lipid A disaccharide synthetase-like protein  36.27 
 
 		 425 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.888234  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0422  hypothetical protein  37.76 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0061  hypothetical protein  34.59 
 
 		 421 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1422  hypothetical protein  36.71 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2258  hypothetical protein  37.97 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.872637  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  35.64 
 
 		 462 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00701  lipid A disaccharide synthetase-like protein  35.64 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01231  hypothetical protein  36.29 
 
 		 425 aa  286  8e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.208139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  36.34 
 
 		 451 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00671  hypothetical protein  35.19 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.997015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0824  hypothetical protein  21.92 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2763  Lipid A disaccharide synthetase  27.71 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.973699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0867  glycosyl transferase family 19  29.31 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.822802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  24.9 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  24.81 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  25 
 
 		 379 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  21.37 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  23.11 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  20.53 
 
 		 384 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  20.21 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  23.94 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  39.22 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  20.23 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>