35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1719 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1719  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  454  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.680386  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  55.86 
 
 
977 aa  242  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  60.17 
 
 
284 aa  141  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  48.35 
 
 
1044 aa  94.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  53.33 
 
 
822 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5005  hypothetical protein  55.88 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  33.9 
 
 
1411 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  45.45 
 
 
672 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  46.15 
 
 
680 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2047  hypothetical protein  42.57 
 
 
398 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  37.36 
 
 
1381 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.33 
 
 
767 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2941  hypothetical protein  41.57 
 
 
395 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
945 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  32.91 
 
 
1228 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
843 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 
1185 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  42.22 
 
 
373 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  38.18 
 
 
1068 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  34.92 
 
 
828 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  38.03 
 
 
1509 aa  45.1  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  40.98 
 
 
899 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
785 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
911 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  37.5 
 
 
1039 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  36.54 
 
 
801 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  42.22 
 
 
992 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 
671 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  47.73 
 
 
838 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  42.22 
 
 
1050 aa  42.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  42.22 
 
 
385 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  45.65 
 
 
1523 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
640 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  42.22 
 
 
675 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  42.22 
 
 
900 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>