More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1460 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1460  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
152 aa  303  8.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0890745  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  70.47 
 
 
152 aa  215  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  63.76 
 
 
152 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  63.09 
 
 
152 aa  201  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  59.73 
 
 
152 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  65.13 
 
 
152 aa  178  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  55.26 
 
 
152 aa  173  9e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  65.56 
 
 
152 aa  172  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  61.59 
 
 
152 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 
151 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  51.97 
 
 
152 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  51.97 
 
 
152 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  51.32 
 
 
152 aa  166  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  54.36 
 
 
151 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  51.32 
 
 
152 aa  164  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 
151 aa  163  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  51.97 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  52.35 
 
 
151 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  44.97 
 
 
159 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  38.93 
 
 
148 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  37.41 
 
 
147 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  36.3 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  40.4 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  39.87 
 
 
150 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  38 
 
 
171 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  37.16 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.19 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  36.24 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  39.26 
 
 
168 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 
147 aa  94  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  94  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  35.33 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
151 aa  93.6  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  36.3 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  38.51 
 
 
148 aa  92  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  33.77 
 
 
148 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 
148 aa  92  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  35.92 
 
 
191 aa  92.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  35.33 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  36 
 
 
148 aa  91.3  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  33.78 
 
 
150 aa  90.5  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 
148 aa  90.1  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  33.77 
 
 
148 aa  90.1  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 
209 aa  88.2  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  33.55 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  32.19 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29830  Plastid ribosomal protein L9, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  33.11 
 
 
195 aa  88.2  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  33.11 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  34.21 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  35.57 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  36.36 
 
 
165 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  32.65 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  31.97 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  32.21 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  33.33 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  32.21 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  33.76 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  32 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
204 aa  85.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  32.21 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  32.21 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  34.25 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  35.76 
 
 
150 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
189 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  32.88 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  34 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  33.33 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  31.54 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
168 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
146 aa  84  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  37.75 
 
 
153 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 
167 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  32.67 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  32.05 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  33.55 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  33.78 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  33.55 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  35.1 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>