35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1403 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1403  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 442 aa  889    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2580  TPR repeat-containing protein  37.67 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4690  TPR repeat-containing protein  37.85 
 
 		 407 aa  253  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040929  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2645  Tetratricopeptide domain protein  39.18 
 
 		 526 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.528519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3471  Tetratricopeptide domain protein  37.88 
 
 		 526 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3039  Tetratricopeptide domain protein  36.05 
 
 		 414 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.77025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.14 
 
 		 782 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0926  hypothetical protein  29.32 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  22.84 
 
 		 957 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 985 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.71 
 
 		 1266 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  24.36 
 
 		 809 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 		 1261 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  21.29 
 
 		 725 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 597 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1054 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 1313 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1162 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  21.18 
 
 		 343 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 1162 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.1 
 
 		 1009 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.5 
 
 		 828 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.43 
 
 		 609 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  23.81 
 
 		 362 aa  46.6  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  19.24 
 
 		 1060 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1025 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 3145 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  19.77 
 
 		 1914 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.84 
 
 		 636 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  19.53 
 
 		 965 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3816  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 3936 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 714 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 1435 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0458945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>