More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0276 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  76.96 
 
 
201 aa  318  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  75 
 
 
204 aa  312  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  72.55 
 
 
206 aa  308  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  69.12 
 
 
200 aa  295  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  62.84 
 
 
198 aa  231  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  65.57 
 
 
198 aa  229  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  55.96 
 
 
222 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  54.64 
 
 
222 aa  204  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  52.28 
 
 
229 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  46.6 
 
 
208 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  49.21 
 
 
206 aa  186  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  45.27 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  47.37 
 
 
207 aa  173  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  45.27 
 
 
205 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  45.27 
 
 
205 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  46.49 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  46.24 
 
 
195 aa  155  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  44.33 
 
 
198 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  47.54 
 
 
210 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  41.29 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  38.24 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  37.75 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  38.42 
 
 
206 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  40.89 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  36.84 
 
 
207 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  38.05 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  35.5 
 
 
201 aa  122  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  34.8 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  40.12 
 
 
295 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  39.52 
 
 
295 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  40.6 
 
 
296 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  41.04 
 
 
295 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  31.78 
 
 
292 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  41.26 
 
 
304 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  32.24 
 
 
292 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  44.03 
 
 
295 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  41.04 
 
 
294 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  35.29 
 
 
283 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  35.18 
 
 
274 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  38.19 
 
 
279 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  44.36 
 
 
288 aa  99.8  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  34.73 
 
 
295 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  36.11 
 
 
293 aa  98.6  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  40.6 
 
 
286 aa  98.6  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  36.6 
 
 
295 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  40.6 
 
 
298 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  36.6 
 
 
295 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  44.36 
 
 
293 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  36.6 
 
 
295 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  40.58 
 
 
294 aa  96.3  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 
292 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  34.59 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  36 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  38.62 
 
 
292 aa  94.7  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  36.94 
 
 
291 aa  94.7  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  37.59 
 
 
291 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  34.59 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  37.93 
 
 
292 aa  94  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  39.1 
 
 
291 aa  94  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  34.59 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  35.14 
 
 
197 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  34.59 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  37.59 
 
 
291 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  37.93 
 
 
439 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  37.59 
 
 
291 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  38.35 
 
 
291 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  31.19 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  34.69 
 
 
220 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  33.72 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  38.35 
 
 
291 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  31.03 
 
 
286 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  34.18 
 
 
220 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  38.35 
 
 
291 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  44.03 
 
 
291 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  31.73 
 
 
273 aa  92.4  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  40.6 
 
 
284 aa  92.4  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  29.23 
 
 
203 aa  92  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  37.59 
 
 
291 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 
285 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  38.35 
 
 
291 aa  91.7  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  30.99 
 
 
285 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  30.05 
 
 
284 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  35.17 
 
 
292 aa  91.3  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  37.37 
 
 
213 aa  91.3  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  39.85 
 
 
293 aa  91.3  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  40.15 
 
 
288 aa  91.3  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  31.03 
 
 
287 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  36.42 
 
 
297 aa  90.9  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  36.84 
 
 
291 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  31.03 
 
 
288 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  30.85 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  31.7 
 
 
288 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  37.88 
 
 
290 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  30.99 
 
 
285 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  30.99 
 
 
285 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  28.11 
 
 
291 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  28.43 
 
 
214 aa  89.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>