More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4870 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  228  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  57.02 
 
 
118 aa  120  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  67.24 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  58.77 
 
 
117 aa  106  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0045  hypothetical protein  66.35 
 
 
116 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9314  hypothetical protein  65.35 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  59.22 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  56.7 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  63.11 
 
 
115 aa  94  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4815  hypothetical protein  61.54 
 
 
120 aa  94  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  50 
 
 
191 aa  93.6  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  48.33 
 
 
116 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  51.09 
 
 
158 aa  87  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  42.34 
 
 
112 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  42.34 
 
 
112 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  40.37 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  42.48 
 
 
108 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  49.51 
 
 
96 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  46.23 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  43.75 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  42.99 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  41.44 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  39.62 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  47.17 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  42.06 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  41.28 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  42.31 
 
 
101 aa  77  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  42.86 
 
 
103 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  36.45 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  38.68 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  40.57 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  43.4 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  40.57 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  41.59 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  38.74 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  41.51 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  37.38 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  38.68 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  36.7 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  37.61 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  37.61 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  41.38 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  52.43 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  42.31 
 
 
110 aa  72  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  36.79 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  36.7 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  41.51 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4904  hypothetical protein  52.43 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193926  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  36.28 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  41.94 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  52.43 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  39.58 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  40.38 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  43.52 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  41.41 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  43.96 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  41.38 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  37.74 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  41.38 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  38.68 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  40.78 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  39.45 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  42.31 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  39.62 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  44.23 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  42.42 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  36.19 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  34 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9028  hypothetical protein  49.54 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  38.95 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  37.61 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0793  hypothetical protein  41.03 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0257165  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  37.61 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  38.53 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  38.53 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  38.53 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  37.61 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  39.05 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  38.18 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  39 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  39.45 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  39.25 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  33.64 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  39.05 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>