More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2702 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 521 aa  1042    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0520634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 527 aa  236  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  33.84 
 
 		 515 aa  231  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 508 aa  230  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 506 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 512 aa  227  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 511 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 506 aa  225  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.87 
 
 		 513 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 521 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.56 
 
 		 525 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 		 662 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.8 
 
 		 525 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.89 
 
 		 525 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 511 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 521 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 525 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 519 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 520 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 503 aa  207  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 539 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0265  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 512 aa  207  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73102  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 508 aa  206  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.05 
 
 		 514 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 530 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  34.26 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 520 aa  203  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 		 519 aa  203  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 511 aa  203  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 578 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.37 
 
 		 526 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 502 aa  199  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.49 
 
 		 561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.27 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.92 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  33.6 
 
 		 500 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.68 
 
 		 561 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.38 
 
 		 518 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.81 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 583 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.3 
 
 		 561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 567 aa  197  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  31.35 
 
 		 549 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.3 
 
 		 582 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2064  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.76 
 
 		 560 aa  196  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 508 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  32.82 
 
 		 508 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 536 aa  196  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.15 
 
 		 561 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 511 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 507 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.87 
 
 		 510 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.3 
 
 		 510 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 522 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.52 
 
 		 563 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  29.2 
 
 		 560 aa  195  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.03 
 
 		 516 aa  195  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.52 
 
 		 563 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.33 
 
 		 563 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.52 
 
 		 563 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 577 aa  194  3e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  30.4 
 
 		 533 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.81 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.52 
 
 		 582 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.89 
 
 		 510 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 544 aa  194  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 		 549 aa  193  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.1 
 
 		 518 aa  194  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.3 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.03 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.3 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 		 492 aa  193  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.3 
 
 		 510 aa  193  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.89 
 
 		 510 aa  192  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.28 
 
 		 524 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  31.03 
 
 		 549 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 524 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.11 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  30.5 
 
 		 555 aa  192  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1256  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 573 aa  192  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.590511 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 512 aa  191  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 505 aa  190  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 532 aa  189  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  26.93 
 
 		 514 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.17 
 
 		 512 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.28 
 
 		 526 aa  189  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2450  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 		 517 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 506 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.61 
 
 		 570 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.35 
 
 		 518 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>