225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2019 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2019  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  999    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  46.65 
 
 		 484 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  46.65 
 
 		 484 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  46.65 
 
 		 484 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  44.1 
 
 		 508 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  43.62 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  43.74 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  42.77 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  44.01 
 
 		 486 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  42.65 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  42.65 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  42.65 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  43.15 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  42.44 
 
 		 478 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  42.65 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  42.65 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  42.65 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  41.94 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  43.38 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  42.44 
 
 		 478 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  42.68 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  43.66 
 
 		 486 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  42.23 
 
 		 478 aa  363  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  42.23 
 
 		 478 aa  362  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  42.5 
 
 		 483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  42.59 
 
 		 492 aa  360  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  42.8 
 
 		 487 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  42.71 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  40.78 
 
 		 498 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  42.68 
 
 		 483 aa  353  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  44.83 
 
 		 486 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  40.42 
 
 		 473 aa  352  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  41.18 
 
 		 494 aa  352  7e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  41.32 
 
 		 496 aa  352  8.999999999999999e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1800  hypothetical protein  41.27 
 
 		 476 aa  352  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  43.12 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  45.41 
 
 		 507 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4038  hypothetical protein  42.22 
 
 		 484 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4063  hypothetical protein  42.42 
 
 		 484 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145391  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  40.65 
 
 		 517 aa  350  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3961  protein of unknown function UPF0061  42.22 
 
 		 484 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0299  hypothetical protein  42.31 
 
 		 484 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.281657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  41.18 
 
 		 480 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  43.51 
 
 		 494 aa  349  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0330  hypothetical protein  41.67 
 
 		 484 aa  349  8e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  40.97 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  43.12 
 
 		 483 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5760  hypothetical protein  44.83 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  42.86 
 
 		 487 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3645  hypothetical protein  42.11 
 
 		 484 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.348897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3841  hypothetical protein  42.31 
 
 		 484 aa  346  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.261021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  40.76 
 
 		 480 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4156  hypothetical protein  41.82 
 
 		 484 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  40.45 
 
 		 491 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  42.92 
 
 		 480 aa  345  8.999999999999999e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  44.37 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  39.63 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  43.64 
 
 		 529 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  40 
 
 		 481 aa  343  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  43.64 
 
 		 529 aa  343  5e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3659  hypothetical protein  41.18 
 
 		 484 aa  342  7e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  40.57 
 
 		 491 aa  342  7e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  40.55 
 
 		 480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  40.55 
 
 		 480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  43.22 
 
 		 487 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  40.85 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  40.04 
 
 		 491 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  40.82 
 
 		 484 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  42.12 
 
 		 487 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  43.54 
 
 		 487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0444  hypothetical protein  43.06 
 
 		 487 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734273  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  38.7 
 
 		 492 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0308  hypothetical protein  40.28 
 
 		 483 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0254223  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  39.1 
 
 		 505 aa  334  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  40.28 
 
 		 497 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  41.19 
 
 		 497 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  45.64 
 
 		 495 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  38.74 
 
 		 502 aa  333  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  38.49 
 
 		 500 aa  332  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  41.19 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  38.49 
 
 		 492 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  45.39 
 
 		 495 aa  332  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  42.05 
 
 		 525 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  39.96 
 
 		 496 aa  330  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  39.68 
 
 		 497 aa  330  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  38.29 
 
 		 500 aa  329  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  39.96 
 
 		 520 aa  329  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  38.57 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2514  hypothetical protein  40.16 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  38.98 
 
 		 483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  39.63 
 
 		 492 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  39.55 
 
 		 491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  38.09 
 
 		 491 aa  326  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  40.65 
 
 		 497 aa  326  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  39.92 
 
 		 518 aa  326  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  41.09 
 
 		 500 aa  325  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  39.6 
 
 		 510 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  42.13 
 
 		 505 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  38.74 
 
 		 499 aa  323  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  41.84 
 
 		 522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>