More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2405 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  657    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  76.44 
 
 		 334 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  65.96 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  57.14 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  59.21 
 
 		 323 aa  347  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  58.72 
 
 		 327 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  56.84 
 
 		 335 aa  341  9e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  55.93 
 
 		 335 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  56.23 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  50.91 
 
 		 340 aa  315  8e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  51.38 
 
 		 342 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  52.87 
 
 		 336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  51.98 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  51.22 
 
 		 333 aa  272  8.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  45.15 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  44.21 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  39.68 
 
 		 340 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  38.39 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  38.67 
 
 		 358 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  36.75 
 
 		 339 aa  185  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  37.58 
 
 		 341 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  37.16 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0384  regulatory protein LacI  37.05 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  34.34 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1061  LacI family response repressor  33.93 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.023904  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.77 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  30.18 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  30.18 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  30.18 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  30.18 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  30.18 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  29.88 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  29.88 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  30.18 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.59 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  29.88 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4583  transcriptional regulator, LacI family  35.07 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0718425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.12 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  31.33 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.43 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17790  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 351 aa  142  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  32.09 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.61 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  32.85 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  28.06 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2354  LacI family transcription regulator  34.39 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756754  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  35.99 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  29.07 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  35.05 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4929  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33528  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  28.49 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  28.49 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.41 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  27.6 
 
 		 329 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  30.42 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  28.02 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.42 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  29.82 
 
 		 343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  31.14 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5484  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 345 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  32.09 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  32.17 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  31.93 
 
 		 335 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4580  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821982 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  33.92 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5204  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210784  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.32 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.32 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5655  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1713  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 326 aa  126  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  27.46 
 
 		 324 aa  126  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.93 
 
 		 335 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  32.46 
 
 		 347 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  27.38 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  31.47 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3199  LacI family transcription regulator  32.26 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.13351 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  32.09 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  32.09 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  32.09 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  32.09 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  32.09 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  27.79 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>