194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2254 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2254  AzlC family protein  100 
 
 
228 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2886  AzlC family protein  56.37 
 
 
226 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.922131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1138  hypothetical protein  53.17 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2908  AzlC family protein  56.8 
 
 
242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000123834  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0917  AzlC family protein  53.43 
 
 
253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  0.5585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3162  AzlC family protein  57.06 
 
 
236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1227  AzlC family protein  53.49 
 
 
244 aa  141  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0324  AzlC family protein  43.17 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1128  AzlC family protein  59.39 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2467  AzlC family protein  52 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0546  AzlC family protein  40.71 
 
 
246 aa  128  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1401  AzlC family protein  41.18 
 
 
236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.143592  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1525  AzlC family protein  55.78 
 
 
249 aa  118  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238717  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0206  AzlC family protein  56.47 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219998  hitchhiker  0.00499995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2770  AzlC family protein  49.05 
 
 
252 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000176844  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15010  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  37.13 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  41.56 
 
 
242 aa  92  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  29.65 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10430  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  42.38 
 
 
255 aa  88.6  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.013447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  31.03 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08460  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  43.53 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.644816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2053  AzlC family protein  40.69 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.547201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  32.52 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  29.19 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  38.05 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  33.73 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  30.82 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  26.62 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4543  AzlC family protein  31.96 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  34.62 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  25.16 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  31.87 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  30.92 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  31.31 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  23.9 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  31.25 
 
 
247 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0679  AzlC family protein  39.77 
 
 
184 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.67 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  32.29 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.18 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  27.67 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  27.67 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  27.67 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  31.41 
 
 
257 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  28.22 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.18 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  31.33 
 
 
258 aa  61.6  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  29.08 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  25.64 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1458  AzlC family protein  33.68 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  26.7 
 
 
241 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  30.98 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  26.6 
 
 
242 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  26.21 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  30.43 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  30.43 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3185  AzlC family protein  34.12 
 
 
227 aa  58.9  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  27.67 
 
 
246 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  32.93 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  34.3 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  29.38 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  29.71 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  24.38 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  34.94 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  32.39 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  30.2 
 
 
282 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  35.19 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  29.38 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  27.66 
 
 
273 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  33.77 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  27.66 
 
 
273 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  25.97 
 
 
242 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  27.66 
 
 
273 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  25.41 
 
 
238 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  28.18 
 
 
285 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  32.76 
 
 
246 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  30.86 
 
 
244 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  30.57 
 
 
239 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  36.88 
 
 
243 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  34.71 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  26.74 
 
 
286 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  31.61 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4080  AzlC family protein  29.38 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  29.17 
 
 
265 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  28.64 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  26.6 
 
 
293 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  25.12 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  33.75 
 
 
234 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  26.25 
 
 
237 aa  52.4  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  24.84 
 
 
228 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  30.29 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  27.42 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  27.37 
 
 
231 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  27.42 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  32.68 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  31.36 
 
 
253 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  26.29 
 
 
238 aa  52  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  28.33 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  24.71 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  32.18 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>