195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1138 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1138  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2886  AzlC family protein  68.47 
 
 		 226 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.922131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0917  AzlC family protein  64.56 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  0.5585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2908  AzlC family protein  66.01 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000123834  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3162  AzlC family protein  54.84 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2254  AzlC family protein  52.78 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1227  AzlC family protein  47.49 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0324  AzlC family protein  44.29 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1401  AzlC family protein  43.17 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.143592  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1128  AzlC family protein  55.17 
 
 		 275 aa  128  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15010  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  40.96 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0546  AzlC family protein  44.08 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2467  AzlC family protein  42.86 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0206  AzlC family protein  50 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219998  hitchhiker  0.00499995 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08460  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  43.5 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.644816 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10430  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  47.45 
 
 		 255 aa  105  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.013447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1525  AzlC family protein  46.97 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2053  AzlC family protein  42.21 
 
 		 225 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.547201 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  32.83 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4543  AzlC family protein  32.84 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2770  AzlC family protein  41.28 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000176844  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  35.26 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4080  AzlC family protein  37.43 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4324  AzlC family protein  33.33 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.238714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4255  AzlC family protein  33.33 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4370  AzlC family protein  33.33 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  27.19 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4284  azaleucine resistance protein AzlC  33.33 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4436  AzlC family protein  33.33 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0679  AzlC family protein  40 
 
 		 184 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1458  AzlC family protein  35.07 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  24.35 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  30.73 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  30.41 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3185  AzlC family protein  35.84 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  26.57 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  30.35 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.29 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  26.74 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  29.65 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  30.65 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  29.33 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  29.33 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  29.65 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  28.51 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  27.04 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  29.65 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  28.86 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  30.15 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  30.15 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  30.15 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  28.79 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  30.48 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  32.75 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  26.58 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2276  AzlC family protein  35.1 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  28.64 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  29.79 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  28.65 
 
 		 242 aa  62  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  28.04 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  26.79 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  28.99 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  27.73 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  30.46 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  28.81 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  31.31 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  25.62 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  31.05 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  31.13 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  29.48 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  27.95 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  24.3 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  30.36 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  27.97 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  28.1 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  24.2 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  33.51 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  28.92 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  27.63 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  23.75 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  27.62 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  28.05 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  27.62 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  27.62 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  27.98 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  31.52 
 
 		 313 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  27.62 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  27.62 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  27.62 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  31.85 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  29.26 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  32.4 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  29.26 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  29.75 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  27.22 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  29.59 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  29.89 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  30.12 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  32.57 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  29.79 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>