173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2770 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2770  AzlC family protein  100 
 
 
252 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000176844  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0324  AzlC family protein  51.04 
 
 
258 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3162  AzlC family protein  59.9 
 
 
236 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2886  AzlC family protein  50.73 
 
 
226 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.922131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0546  AzlC family protein  51.77 
 
 
246 aa  176  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1227  AzlC family protein  59.76 
 
 
244 aa  165  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2467  AzlC family protein  55.19 
 
 
247 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1401  AzlC family protein  46.79 
 
 
236 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.143592  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2254  AzlC family protein  49.05 
 
 
228 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1138  hypothetical protein  48.02 
 
 
243 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0917  AzlC family protein  46.67 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  0.5585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2908  AzlC family protein  54 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000123834  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1128  AzlC family protein  52.02 
 
 
275 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1525  AzlC family protein  58.59 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238717  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15010  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  34.57 
 
 
256 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10430  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  53.33 
 
 
255 aa  125  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.013447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0206  AzlC family protein  55.43 
 
 
260 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219998  hitchhiker  0.00499995 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08460  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  48.17 
 
 
224 aa  122  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.644816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4543  AzlC family protein  35.85 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2053  AzlC family protein  39.3 
 
 
225 aa  98.6  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.547201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4080  AzlC family protein  35.08 
 
 
219 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1458  AzlC family protein  34.82 
 
 
259 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4436  AzlC family protein  33.16 
 
 
219 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4255  AzlC family protein  33.16 
 
 
219 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4324  AzlC family protein  33.16 
 
 
219 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238714 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4370  AzlC family protein  33.16 
 
 
219 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4284  azaleucine resistance protein AzlC  33.16 
 
 
219 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  34.01 
 
 
242 aa  85.5  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0679  AzlC family protein  41.21 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3185  AzlC family protein  37.31 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  30.18 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  29.28 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  29.09 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  32.84 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  29.2 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  30.09 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  23.96 
 
 
233 aa  72  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  28.25 
 
 
230 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  28.25 
 
 
230 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  28.25 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  36.1 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  32.67 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  25 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  29.89 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  31.82 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  29.79 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  23.79 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  27.78 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  28.9 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  34.36 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  29.82 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  31.7 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  32.43 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  32.43 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  30.88 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  31.21 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  32.12 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  34.55 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  29.8 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  26.76 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  26.76 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  22.83 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  32.66 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  32.37 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  24.51 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  21.98 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  26.76 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  26.76 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  26.76 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  31.79 
 
 
280 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  32.37 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  24.64 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  27.23 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  32.73 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  26.76 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  27.86 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  27.46 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  31.79 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  31.79 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  27.32 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  27.05 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  30.41 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  27.14 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  31.79 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  28.44 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  32.51 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  24.86 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  26.57 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.64 
 
 
241 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  26.57 
 
 
273 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  23.12 
 
 
238 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  32.48 
 
 
238 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  26.09 
 
 
285 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  23.12 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  25.24 
 
 
242 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  28.26 
 
 
231 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  31.03 
 
 
234 aa  62  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  30.54 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  24.88 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  28.31 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>