193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1128 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1128  AzlC family protein  100 
 
 
275 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2886  AzlC family protein  55.07 
 
 
226 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.922131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3162  AzlC family protein  57.71 
 
 
236 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1138  hypothetical protein  55.43 
 
 
243 aa  155  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2254  AzlC family protein  51.98 
 
 
228 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0324  AzlC family protein  42.02 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0917  AzlC family protein  52.72 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  0.5585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2467  AzlC family protein  52.04 
 
 
247 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1227  AzlC family protein  49.41 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581374  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0546  AzlC family protein  46.95 
 
 
246 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10430  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  52.83 
 
 
255 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.013447  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1401  AzlC family protein  45.24 
 
 
236 aa  125  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.143592  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08460  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  49.76 
 
 
224 aa  122  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.644816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2908  AzlC family protein  56.47 
 
 
242 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000123834  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0206  AzlC family protein  52.54 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219998  hitchhiker  0.00499995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15010  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  35.56 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1525  AzlC family protein  54.76 
 
 
249 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238717  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2770  AzlC family protein  51.35 
 
 
252 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000176844  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2053  AzlC family protein  41.71 
 
 
225 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.547201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4543  AzlC family protein  33.96 
 
 
227 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  32.49 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  32.6 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  27.57 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  36.84 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  27.36 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.36 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4080  AzlC family protein  33.33 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  26.37 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1458  AzlC family protein  35.71 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  32.62 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  26.37 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  26.37 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  26.37 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  26.37 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  26.37 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  26.67 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  34.29 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  34.29 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  26.37 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  34.29 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  25.37 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  31.46 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  26.94 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  29.3 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  30.11 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4436  AzlC family protein  30.51 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3185  AzlC family protein  35.88 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  26.53 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4324  AzlC family protein  30.51 
 
 
219 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238714 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4370  AzlC family protein  30.51 
 
 
219 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  21.78 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4255  AzlC family protein  30.51 
 
 
219 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4284  azaleucine resistance protein AzlC  30.51 
 
 
219 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  23.93 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  27.11 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  27.61 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  27.06 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  26.53 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  25.61 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  25.61 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  26.53 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  26.51 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  26.88 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  26.75 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  30.34 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  26.37 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  34.15 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  28.09 
 
 
228 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  27.42 
 
 
230 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  26.98 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  26.88 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  27.44 
 
 
238 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  29.6 
 
 
232 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  30.07 
 
 
233 aa  62  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0679  AzlC family protein  37.43 
 
 
184 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  25 
 
 
238 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  24.48 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  32.76 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  25.15 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  28.57 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  25.73 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  31.61 
 
 
234 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  35.8 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  24.24 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  28.57 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  27.43 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  25.15 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  24.24 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  23.84 
 
 
238 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  29.31 
 
 
240 aa  60.1  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  25.15 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  24.86 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  30.32 
 
 
235 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  24.86 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  30.17 
 
 
247 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  25.14 
 
 
255 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  25.15 
 
 
250 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  23.72 
 
 
231 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  23.72 
 
 
231 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  25.98 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>