More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0051 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0051  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00174909  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07689  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.754049  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt23  tRNA-Phe  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0044  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000279545  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0064  tRNA-Phe  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0324982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0022  tRNA-Phe  97.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0066  tRNA-Phe  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.572746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0027  tRNA-Asn  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000466235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0041  tRNA-Asn  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000273116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0568  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 155 bp  71.9  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0028  tRNA-Asn  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0043  tRNA-Asn  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00393457  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0269  tRNA-Phe  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00560229  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0017  tRNA-Phe  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0023  tRNA-Phe  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0019  tRNA-Phe  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0030  tRNA-Phe  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0867415  normal  0.184559 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t12  tRNA-Phe  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0141221  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0738  tRNA-Phe  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0051  tRNA-Phe  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0676526  normal  0.132155 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0022  tRNA-Phe  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.688613  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_711  tRNA-Phe  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.016147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0046  tRNA-Phe  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0060  tRNA-Phe  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456959  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0011  tRNA-Phe  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAPheVIMSS1309284  tRNA-Phe  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0001  tRNA-Phe  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0729187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0034  tRNA-Phe  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAPheVIMSS1309159  tRNA-Phe  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0035  tRNA-Phe  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0014  tRNA-Phe  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0887945  normal  0.384198 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAPheVIMSS1309181  tRNA-Phe  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.118097 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0007  tRNA-Phe  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0053  tRNA-Phe  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAPheVIMSS1309115  tRNA-Phe  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAPheVIMSS1309084  tRNA-Phe  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.690002  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAPheVIMSS1309357  tRNA-Phe  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0048  tRNA-Phe  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0006  tRNA-Phe  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0005  tRNA-Phe  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0171  tRNA-Phe  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0039  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000227587  normal  0.0269838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0017  tRNA-Phe  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0754329  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0002  tRNA-Phe  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R13  tRNA-Phe  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0038  tRNA-Phe  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0080  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t03  tRNA-Phe  93.18 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485115  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0264  tRNA-Phe  93.18 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00100178  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0031  tRNA-Asn  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000781489  hitchhiker  0.000000692381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4594  tRNA-Phe  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0004  tRNA-Phe  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0010  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0035  tRNA-Phe  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0037  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0030  tRNA-Asn  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000864029  hitchhiker  0.00000418087 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0038  tRNA-Phe  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000542826  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0113  tRNA-Phe  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0034  tRNA-Phe  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000955426  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0005  tRNA-Phe  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.497838 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0029  tRNA-Phe  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0045  tRNA-Phe  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0061  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000736114  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0022  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0055  tRNA-Phe  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.579844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0005  tRNA-Phe  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0014  tRNA-Phe  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000072957  hitchhiker  0.009028 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0036  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000108389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0046  tRNA-Phe  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.300916  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0001  tRNA-Phe  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0037  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0006  tRNA-Phe  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201329  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0062  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357988  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0030  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0053  tRNA-Phe  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.189641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0029  tRNA-Phe  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0014  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.58788  hitchhiker  0.00239858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0015  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0046  tRNA-Phe  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00122164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0048  tRNA-Phe  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0050  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0001  tRNA-Phe  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0354  tRNA-Phe  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.570155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0075  tRNA-Phe  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283393  normal  0.209265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0060  tRNA-Phe  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0136  tRNA-Phe  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.740325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0018  tRNA-Phe  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0070  tRNA-Phe  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00525701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0594  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0011  tRNA-Phe  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443176  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0049  tRNA-Phe  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000790035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0075  tRNA-Phe  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>