34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3692 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  752    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  45.41 
 
 		 650 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  47.21 
 
 		 671 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  48.92 
 
 		 671 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  37.2 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  37.23 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  36.22 
 
 		 384 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  39.58 
 
 		 366 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  32.65 
 
 		 374 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  30.61 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  32.32 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  28.94 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  26.24 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  24.48 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  22.28 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  23.74 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  23.19 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  28.72 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  25.22 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  26.09 
 
 		 409 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  21.33 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  26.67 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  26.27 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  26.49 
 
 		 474 aa  52.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  26.32 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  26.63 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  25.75 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  25.07 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  22.52 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1744  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.17 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  23.53 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  23.29 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  24.72 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  22.64 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>