More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2782 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2632  Aldehyde Dehydrogenase  70.52 
 
 		 461 aa  690    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2129  aldehyde dehydrogenase  70.52 
 
 		 461 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0680  aldehyde dehydrogenase  78.87 
 
 		 459 aa  726    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429817  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2782  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 460 aa  949    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1869  aldehyde dehydrogenase  71.83 
 
 		 461 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  70.52 
 
 		 461 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1611  aldehyde dehydrogenase  70.07 
 
 		 462 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.917545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2318  putative aldehyde dehydrogenase  69.41 
 
 		 462 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0992  aldehyde dehydrogenase  69.2 
 
 		 462 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4548  aldehyde dehydrogenase  65.73 
 
 		 462 aa  594  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3882  aldehyde dehydrogenase  58.61 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  57.55 
 
 		 462 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  53.04 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2102  aldehyde dehydrogenase  52.94 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0577073  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2793  aldehyde dehydrogenase  52.92 
 
 		 464 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145836  normal  0.229577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  52.39 
 
 		 465 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0771  Aldehyde Dehydrogenase  55.58 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2531  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.76 
 
 		 492 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4672  Aldehyde Dehydrogenase  52.84 
 
 		 489 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 		 466 aa  476  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2389  aldehyde dehydrogenase  52.86 
 
 		 487 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07141  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein (Eurofung)  39.44 
 
 		 466 aa  359  6e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549697 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01720  aldehyde dehydrogenase, putative  40.22 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.265916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4025  Aldehyde Dehydrogenase  40.47 
 
 		 463 aa  322  7e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 		 455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  36.14 
 
 		 457 aa  288  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1238  Aldehyde Dehydrogenase  35.16 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  30.55 
 
 		 466 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  31.72 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.97 
 
 		 522 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  32.38 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  30.07 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  30.84 
 
 		 455 aa  237  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  28.63 
 
 		 457 aa  236  6e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  30.91 
 
 		 449 aa  235  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  34.48 
 
 		 496 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  31.13 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  33.85 
 
 		 457 aa  232  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  41.83 
 
 		 505 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  30.57 
 
 		 466 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  33.74 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  33.19 
 
 		 521 aa  229  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  33.62 
 
 		 479 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  31.51 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2542  aldehyde dehydrogenase  29.67 
 
 		 454 aa  227  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  32.02 
 
 		 463 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  35.25 
 
 		 533 aa  227  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  29.27 
 
 		 462 aa  226  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  32.59 
 
 		 463 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2394  aldehyde dehydrogenase  32.95 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0666523  normal  0.869122 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  32.1 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  32.9 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  29.05 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  31.03 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  38.24 
 
 		 487 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.75 
 
 		 479 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  30 
 
 		 454 aa  223  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.75 
 
 		 477 aa  222  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.75 
 
 		 479 aa  222  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1608  aldehyde dehydrogenase  32.48 
 
 		 443 aa  222  9e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.54 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.54 
 
 		 479 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.54 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  30.65 
 
 		 526 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.69 
 
 		 501 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  31.94 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.54 
 
 		 479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.19 
 
 		 487 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  34 
 
 		 510 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  32.95 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.54 
 
 		 479 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31599  succinate semialdehyde dehydrogenase  30.44 
 
 		 471 aa  219  7e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  32.21 
 
 		 457 aa  219  7e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  32.96 
 
 		 480 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  31.97 
 
 		 452 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.54 
 
 		 479 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.32 
 
 		 479 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  29.44 
 
 		 460 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1090  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  31.98 
 
 		 468 aa  219  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.033581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  31.85 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  31.26 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2911  Aldehyde Dehydrogenase  34.38 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09770  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  33.59 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00172669  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.93 
 
 		 521 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1124  aldehyde dehydrogenase family protein  36.14 
 
 		 458 aa  217  4e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.115238  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  31.71 
 
 		 490 aa  217  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  30.24 
 
 		 452 aa  216  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0330  aldehyde dehydrogenase family protein  29.61 
 
 		 457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0316513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.29 
 
 		 508 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1749  lactaldehyde dehydrogenase  33.83 
 
 		 481 aa  216  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.451931  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2318  Aldehyde Dehydrogenase  30.04 
 
 		 452 aa  216  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  32.54 
 
 		 479 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  29.84 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.53 
 
 		 471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  34.24 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  30.15 
 
 		 456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  29.23 
 
 		 460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  32.35 
 
 		 507 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.06 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  29.45 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>