More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1798 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1798  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
580 aa  1158    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426029 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2644  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.46 
 
 
571 aa  351  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  30.2 
 
 
452 aa  209  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  27.47 
 
 
466 aa  177  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  29.66 
 
 
472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  29.66 
 
 
461 aa  174  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  26.96 
 
 
462 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  30.3 
 
 
500 aa  173  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  29.48 
 
 
445 aa  171  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  28.89 
 
 
461 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  27.7 
 
 
463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  30.93 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  28.79 
 
 
466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  29.07 
 
 
486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  26.55 
 
 
452 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  26.55 
 
 
452 aa  163  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  26.91 
 
 
464 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  28.84 
 
 
517 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  26.14 
 
 
453 aa  162  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  27.68 
 
 
462 aa  162  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  28.29 
 
 
463 aa  161  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  29.42 
 
 
458 aa  160  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  28.29 
 
 
463 aa  160  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  28.29 
 
 
463 aa  160  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  28.29 
 
 
463 aa  160  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  28.29 
 
 
463 aa  160  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  28.29 
 
 
463 aa  160  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  28.29 
 
 
463 aa  160  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  28.29 
 
 
463 aa  160  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  28.29 
 
 
463 aa  159  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  30.04 
 
 
465 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  29.33 
 
 
468 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  28.44 
 
 
451 aa  157  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  28.25 
 
 
488 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  29.66 
 
 
468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  27.11 
 
 
463 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  27.11 
 
 
463 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  27.11 
 
 
463 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  27.11 
 
 
463 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  27.11 
 
 
463 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  28.82 
 
 
449 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  30.34 
 
 
509 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  26.95 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  29.84 
 
 
462 aa  153  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  29.84 
 
 
462 aa  153  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  29.84 
 
 
462 aa  153  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  29.84 
 
 
462 aa  153  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  29.84 
 
 
462 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  29.62 
 
 
462 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  28.19 
 
 
462 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  29.05 
 
 
461 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  27.96 
 
 
462 aa  150  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  28.57 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0246  putative transporter  28.66 
 
 
468 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  28.64 
 
 
438 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  28.64 
 
 
462 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  28.7 
 
 
462 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  28.83 
 
 
462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  28.83 
 
 
462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  28.83 
 
 
462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0445  putative transporter  28.54 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04610  putative transporter  29.08 
 
 
461 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  27.9 
 
 
462 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  30.56 
 
 
434 aa  138  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  28.38 
 
 
459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.243938 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  25.89 
 
 
466 aa  135  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  25.89 
 
 
466 aa  135  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  25.89 
 
 
466 aa  135  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0826  uracil-xanthine permease  25.89 
 
 
466 aa  135  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  25.89 
 
 
466 aa  135  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  25.89 
 
 
466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  28.6 
 
 
459 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  28.38 
 
 
459 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0182  aminoacyl-tRNA synthetase, class Ia  25.52 
 
 
529 aa  133  9e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02715  predicted transporter  25.68 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  27.55 
 
 
459 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  27.89 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02677  hypothetical protein  25.68 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92624  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  28.19 
 
 
462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1664  xanthine/uracil permease family protein  25.04 
 
 
580 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.139365  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1266  xanthine/uracil permease  30.21 
 
 
427 aa  130  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  26.55 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000668836  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  30.97 
 
 
466 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  25.64 
 
 
465 aa  124  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1085  xanthine permease  27 
 
 
424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1785  uracil-xanthine permease  29.32 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3234  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.87 
 
 
577 aa  120  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627871  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0864  xanthine/uracil permease-like protein  25.11 
 
 
566 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  24.55 
 
 
442 aa  118  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0234  uracil-xanthine permease  26.71 
 
 
487 aa  117  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.72868  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  26.41 
 
 
458 aa  114  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  27.05 
 
 
479 aa  113  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  27.63 
 
 
478 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  27.14 
 
 
458 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  26.24 
 
 
460 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  24.83 
 
 
640 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  25.11 
 
 
497 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  25.51 
 
 
825 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  28.72 
 
 
470 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  26.48 
 
 
469 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>