More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1293 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1293  TldD/PmbA family protein  100 
 
 		 460 aa  952    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00519979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1846  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.46 
 
 		 459 aa  510  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0233195 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.04 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.09 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.56 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  29.59 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.63 
 
 		 443 aa  163  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.46 
 
 		 486 aa  163  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27 
 
 		 463 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  33.06 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.16 
 
 		 470 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  33.61 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.17 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  28.71 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.2 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  28.85 
 
 		 481 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.41 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.25 
 
 		 496 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  29.58 
 
 		 471 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0812  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 		 475 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.58 
 
 		 489 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  31.22 
 
 		 481 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.42 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  31.97 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  29.48 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.58 
 
 		 486 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.58 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  28.74 
 
 		 481 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.85 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.78 
 
 		 476 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  28.94 
 
 		 481 aa  153  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  38.2 
 
 		 486 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.37 
 
 		 480 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  29.59 
 
 		 480 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  30.93 
 
 		 481 aa  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.32 
 
 		 475 aa  153  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  29.71 
 
 		 473 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 		 473 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0893  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.54 
 
 		 475 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.61 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.59 
 
 		 479 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.91 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  28.78 
 
 		 445 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.93 
 
 		 471 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2236  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.42 
 
 		 471 aa  151  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0328346 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.32 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.66 
 
 		 488 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.06 
 
 		 437 aa  149  7e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.04 
 
 		 496 aa  149  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.93 
 
 		 490 aa  149  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  31.43 
 
 		 497 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  29.33 
 
 		 475 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  30 
 
 		 481 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  30.07 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  29.58 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  29.15 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  37.01 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  29.58 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  30.07 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0100  microcin-processing peptidase 2  30.3 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.884188  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  29.58 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  29.58 
 
 		 481 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  28.79 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.79 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  30.07 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  31.43 
 
 		 497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  36.89 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.89 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  36.89 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  36.89 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.06 
 
 		 488 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  36.89 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.27 
 
 		 480 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  37.4 
 
 		 482 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.4 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  36.89 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  36.89 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  31.43 
 
 		 497 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  30.07 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.89 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  28.97 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  38.43 
 
 		 481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  31.71 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  29.58 
 
 		 481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.1 
 
 		 475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  38.31 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  32.63 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  36.48 
 
 		 481 aa  147  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0632  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40 
 
 		 512 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.17 
 
 		 470 aa  146  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4592  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.67 
 
 		 475 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  29.95 
 
 		 488 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0657  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40 
 
 		 488 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.88 
 
 		 474 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  31.85 
 
 		 493 aa  146  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  38.02 
 
 		 480 aa  146  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2645  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  29.34 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40 
 
 		 488 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0739  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.58 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>