More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0654 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  100 
 
 
390 aa  801    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  47.45 
 
 
400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2785  amidohydrolase  43.57 
 
 
385 aa  322  6e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000905599  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3623  amidohydrolase  38.7 
 
 
399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412782  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1876  amidohydrolase  41.04 
 
 
389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  39.33 
 
 
394 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  40.86 
 
 
390 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1139  amidohydrolase  42.18 
 
 
385 aa  292  9e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  38.5 
 
 
405 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  38.62 
 
 
394 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  38.08 
 
 
403 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  37.82 
 
 
403 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  42.63 
 
 
393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  38.52 
 
 
389 aa  279  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  38.85 
 
 
398 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  40 
 
 
389 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  39.9 
 
 
389 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  39.47 
 
 
389 aa  275  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  39.49 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.78 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  36.32 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.47 
 
 
389 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  39.47 
 
 
389 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.23 
 
 
389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  40.15 
 
 
390 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  39.21 
 
 
389 aa  272  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  39.47 
 
 
389 aa  272  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  39.21 
 
 
389 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  38.66 
 
 
398 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  39.45 
 
 
390 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.08 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  40.71 
 
 
380 aa  268  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  37.97 
 
 
396 aa  268  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  39.47 
 
 
389 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  40.46 
 
 
387 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1065  carboxypeptidase  39.73 
 
 
396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.094231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  38.79 
 
 
389 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  38.54 
 
 
390 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0634  carboxypeptidase  39.73 
 
 
396 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.062973  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  36.55 
 
 
405 aa  265  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0708  carboxypeptidase  39.73 
 
 
396 aa  265  8e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  35.2 
 
 
391 aa  265  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0991  amidohydrolase  35.97 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  39.21 
 
 
394 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  39.39 
 
 
395 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  38.98 
 
 
394 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  36.14 
 
 
413 aa  264  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  38.16 
 
 
381 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  40.11 
 
 
388 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  38.16 
 
 
392 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  39.24 
 
 
387 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.95 
 
 
391 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  40.16 
 
 
395 aa  262  6.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.95 
 
 
391 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  35.17 
 
 
423 aa  262  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  37.84 
 
 
397 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  34.44 
 
 
391 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  39.35 
 
 
381 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  34.95 
 
 
391 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  39.46 
 
 
381 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  39.18 
 
 
387 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.44 
 
 
391 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.12 
 
 
379 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  35.2 
 
 
391 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  38.81 
 
 
394 aa  260  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.69 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  38.01 
 
 
480 aa  259  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  34.82 
 
 
408 aa  259  8e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  34.44 
 
 
391 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.44 
 
 
391 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  36.97 
 
 
390 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1002  amidohydrolase family protein  35.87 
 
 
408 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000070505  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  36.62 
 
 
387 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  37.36 
 
 
381 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  36.87 
 
 
387 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  38.9 
 
 
395 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  37.34 
 
 
397 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  38.42 
 
 
400 aa  257  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  38.05 
 
 
387 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  34.91 
 
 
430 aa  256  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  38.31 
 
 
396 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  40.59 
 
 
396 aa  255  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  32.39 
 
 
405 aa  255  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  37.88 
 
 
396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1434  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.43 
 
 
395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  38.06 
 
 
396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  36.43 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  39.36 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  39.63 
 
 
399 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  39.63 
 
 
399 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  38.26 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  36.98 
 
 
399 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  38.85 
 
 
396 aa  253  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  36.68 
 
 
381 aa  252  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  37.34 
 
 
388 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  37.79 
 
 
387 aa  252  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  36.13 
 
 
393 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  37.79 
 
 
387 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  38.71 
 
 
396 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1675  amidohydrolase  36.99 
 
 
390 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>