More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0795 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0795  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
132 aa  264  4e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0026055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  66.94 
 
 
128 aa  169  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  66.09 
 
 
131 aa  166  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
129 aa  166  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  60.61 
 
 
129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  62.3 
 
 
129 aa  164  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 
129 aa  163  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  56.82 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  56.82 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  56.82 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  62.61 
 
 
131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 
137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  64.35 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  56.82 
 
 
129 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 
129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  62.61 
 
 
131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  63.11 
 
 
131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  59.84 
 
 
129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 
129 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  59.84 
 
 
129 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 
130 aa  158  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  61.21 
 
 
129 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  58.14 
 
 
183 aa  158  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  61.21 
 
 
129 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  59.02 
 
 
131 aa  158  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
129 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  55.3 
 
 
129 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  63.79 
 
 
132 aa  157  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  59.84 
 
 
129 aa  157  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  56.06 
 
 
129 aa  156  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 
131 aa  156  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  61.6 
 
 
130 aa  156  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 
130 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 
139 aa  155  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 
129 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
130 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  60.34 
 
 
129 aa  155  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  61.72 
 
 
134 aa  154  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 
129 aa  154  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  59.02 
 
 
129 aa  154  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
131 aa  153  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01430  ribosomal protein S11  66.96 
 
 
132 aa  153  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 
130 aa  153  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
138 aa  153  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 
129 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0203  ribosomal protein S11  61.16 
 
 
126 aa  152  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 
129 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  53.79 
 
 
132 aa  151  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 
134 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 
134 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 
134 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  59.48 
 
 
129 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 
133 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
129 aa  151  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 
135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  63.71 
 
 
133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  61.29 
 
 
134 aa  150  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  61.48 
 
 
135 aa  150  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 
133 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  61.9 
 
 
137 aa  150  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1315  ribosomal protein S11  56.06 
 
 
132 aa  150  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3981  30S ribosomal protein S11  62.4 
 
 
129 aa  150  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764939  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  61.98 
 
 
128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 
127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  56.69 
 
 
138 aa  150  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 
135 aa  150  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 
133 aa  149  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2210  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 
130 aa  149  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2751  ribosomal protein S11  59.84 
 
 
129 aa  149  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  56.06 
 
 
129 aa  149  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
129 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 
133 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  59.02 
 
 
134 aa  148  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 
136 aa  148  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 
133 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  53.03 
 
 
129 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  61.29 
 
 
135 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 
137 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  63.49 
 
 
134 aa  148  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 
137 aa  148  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4775  30S ribosomal protein S11  59.85 
 
 
129 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>