More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0203 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0203  ribosomal protein S11  100 
 
 		 126 aa  253  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 183 aa  185  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  69.83 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  66.39 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 		 129 aa  169  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  169  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 130 aa  169  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  65.52 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  65.52 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  65.52 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  63.79 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  63.79 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  63.79 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  63.79 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  64.66 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  62.93 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  62.93 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  62.93 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  62.07 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  62.93 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  62.07 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  62.07 
 
 		 130 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  63.79 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  62.07 
 
 		 129 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  61.21 
 
 		 130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  62.07 
 
 		 129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  61.21 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  60.48 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  63.79 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 131 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  61.74 
 
 		 130 aa  157  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 		 134 aa  156  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 		 134 aa  156  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 		 134 aa  156  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04498  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.846656  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0778  30S ribosomal protein S11  64.04 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  61.21 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 134 aa  153  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 		 134 aa  153  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  153  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  60.34 
 
 		 133 aa  153  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 134 aa  153  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 134 aa  153  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2528  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481275  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2178  30S ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 134 aa  151  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2456  30S ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  60.34 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  59.13 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl149  30S ribosomal protein S11  57.39 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  59.48 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  56.56 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  59.48 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  59.48 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  59.48 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  59.48 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  58.26 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  59.48 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  58.62 
 
 		 134 aa  150  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  59.48 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  60.34 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4775  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  58.54 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  58.62 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  58.62 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  58.62 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0455  30S ribosomal protein S11  59.65 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.348659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>