26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11593 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  265  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  50.4 
 
 
139 aa  120  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  39.06 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  34.65 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  35.21 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  37.01 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  34.33 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  34.59 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  35.34 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  33.07 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  32.82 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  35.07 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  30.53 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0598  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0817305  normal  0.249428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  28.93 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0589  PilT protein domain protein  33.82 
 
 
136 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.663237  normal  0.0136168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0946  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 
135 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  28.1 
 
 
133 aa  47.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  26.15 
 
 
130 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  29.55 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1454  PilT protein-like  30.95 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  31.97 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4362  PilT protein domain protein  30.6 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.151673  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3760  PilT protein domain protein  29.01 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383915  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  26.32 
 
 
132 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10231  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>