More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10843 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10843  deaminase  100 
 
 
140 aa  294  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.52974e-17  hitchhiker  0.000000121156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  73.55 
 
 
167 aa  183  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  58.47 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  53.39 
 
 
154 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  53.39 
 
 
154 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.91 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  40.19 
 
 
159 aa  77  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.19 
 
 
159 aa  77  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.39 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.19 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.29 
 
 
164 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  40.4 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  36.75 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.51 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  36.84 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  37.5 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.29 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  39.39 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.94 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.14 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.36 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  36.21 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  36.79 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.05 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60 
 
 
162 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  33.67 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.67 
 
 
214 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  33.61 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.5 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.61 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.74 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.1 
 
 
165 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.9 
 
 
160 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.94 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.85 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
181 aa  60.1  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6533  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.25 
 
 
185 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.19 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0427  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.11 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5594  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.68 
 
 
166 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  54.55 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.89 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.62 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.94 
 
 
524 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.94 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  45.9 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13784  cytidine/deoxycytidylate deaminase  38.1 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.507969 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  45.9 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.48 
 
 
155 aa  57  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.14 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0738  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 
211 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  38.46 
 
 
186 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.62 
 
 
190 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1926  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.36 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512826  normal  0.748539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.92 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  37.11 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  42.17 
 
 
182 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1214  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.04 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  45.9 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  37.5 
 
 
158 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  35.64 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.17 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.78 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.18 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.09 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.77 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  35.92 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  39.44 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.89 
 
 
301 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.75 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.78 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  41.27 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.82 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103435  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  44.26 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.06 
 
 
484 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.06 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.56 
 
 
158 aa  53.9  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.71 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.55 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  40.98 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  39.76 
 
 
182 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.62 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.09 
 
 
223 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  40 
 
 
153 aa  52.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  45.45 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.76 
 
 
162 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.65 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.81 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.55 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.24 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  47.27 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52 
 
 
148 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  48.21 
 
 
151 aa  52  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0941  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.36 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180946  normal  0.53419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>