More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10550 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10550  dolichyl-phosphate sugar synthase  100 
 
 
210 aa  410  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0345787  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0704  glycosyl transferase family protein  77.14 
 
 
218 aa  297  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0710  glycosyl transferase family protein  77.14 
 
 
239 aa  296  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237777  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0724  glycosyl transferase family protein  77.14 
 
 
239 aa  296  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0259046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0886  glycosyl transferase family protein  71.9 
 
 
218 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  61.14 
 
 
224 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  53.11 
 
 
694 aa  204  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0979  glycosyl transferase family protein  54.5 
 
 
226 aa  197  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2922  glycosyl transferase family 2  51.18 
 
 
217 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.895357  hitchhiker  0.00151129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1719  glycosyl transferase family 2  53.62 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530897  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
459 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1563  glycosyl transferase family protein  43.69 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 
394 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
242 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 
389 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0306  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 
265 aa  85.1  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
259 aa  84.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0422  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.73 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 
378 aa  82.4  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  36.98 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  31.96 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  33.83 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  44.86 
 
 
291 aa  79  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  31.05 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.05 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  32.84 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
430 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
420 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.48 
 
 
252 aa  74.7  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  33.64 
 
 
874 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  31.96 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  40.95 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.18 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.98 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
414 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2272  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.632375  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.84 
 
 
382 aa  72.4  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
586 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
231 aa  72  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  30 
 
 
410 aa  72  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
340 aa  71.2  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4901  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.447134  decreased coverage  0.000680692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  39 
 
 
480 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3758  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102205  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  40.38 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.86 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.86 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.65 
 
 
264 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.86 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
411 aa  68.2  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  45 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  33.64 
 
 
749 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
311 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  27.96 
 
 
329 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
346 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  31.11 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
321 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5474  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.47 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0224375 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  27.52 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1295  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
357 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  26.4 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>