More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2414 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  728    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  60.06 
 
 		 362 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  60.52 
 
 		 363 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  56.98 
 
 		 351 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  54.67 
 
 		 353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  54.39 
 
 		 353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  56.37 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  53.5 
 
 		 363 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  54.86 
 
 		 363 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  52.89 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  54.57 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  49 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  48.56 
 
 		 351 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  48.56 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  48.85 
 
 		 351 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  41.64 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  41 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  38.41 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  41.84 
 
 		 239 aa  169  9e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.86 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 286 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  29.12 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4441  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 294 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  29.48 
 
 		 313 aa  86.7  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  28.15 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  25.63 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.55 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  30.46 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  28 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46747  predicted protein  27.87 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  28.96 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.96 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.53 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  27.06 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  39.57 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  26.76 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  39.57 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.21 
 
 		 234 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 231 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3698  Methyltransferase type 11  29 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.81 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0872  hypothetical protein  28.46 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  35.51 
 
 		 524 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.33 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2223  methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128403  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.24 
 
 		 215 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  30.38 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  31.52 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 201 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 196 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  30.15 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  34 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.87 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  27.7 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2558  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.65 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.228971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.57 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.77 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.32 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  38.53 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  33.94 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  31.48 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.03 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  23.51 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.43 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  31.48 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.34 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  31.43 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  27.85 
 
 		 422 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4431  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.184386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  25 
 
 		 658 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2332  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.43 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000815001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1588  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.666171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>