More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2412 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2412  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 		 270 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163549  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  56.58 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  51.9 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  48.55 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  51.74 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  46.58 
 
 		 254 aa  235  7e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  51.44 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  46.78 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  52.16 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  46.12 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  49.79 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  47.7 
 
 		 261 aa  232  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.73 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  46.58 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  47.41 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.4 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  45.06 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50 
 
 		 278 aa  224  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  45.38 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  45.95 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  41.57 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  43.44 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  46.19 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  46.12 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.38 
 
 		 248 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  46.81 
 
 		 251 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  45.38 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2150  band 7 protein  43.02 
 
 		 259 aa  221  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  46.19 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.21 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  47.75 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  46.06 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.15 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  44.59 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  46.58 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  44.59 
 
 		 252 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  43.72 
 
 		 249 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  45.11 
 
 		 252 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  44.54 
 
 		 252 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.58 
 
 		 270 aa  218  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  45.49 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  45.8 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.68 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.75 
 
 		 286 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.25 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.7 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  45.25 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.44 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  47.51 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.44 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  42.44 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2886  hypothetical protein  47.46 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  42.86 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  43.95 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  43.95 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  43.59 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.51 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.11 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  44.31 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2530  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.13 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  45.05 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  43.59 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1161  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.44 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.17 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.84 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  46.79 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  44.26 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.71 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  44.96 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  42.44 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  40.71 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  40.71 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  46.35 
 
 		 258 aa  209  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0554  putative stomatin-like protein  41.83 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  44.59 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0620  band 7 protein  47.39 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05890  putative stomatin-like protein  44.91 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.774362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3028  hypothetical protein  47.03 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  45.95 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.89 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  43.24 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  45 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  43.2 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28570  SPFH domain, Band 7 family protein  48.18 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.44 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  43.28 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.66 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  47.42 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  43.22 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  40.76 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0991  band 7 protein  44.34 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.91 
 
 		 259 aa  201  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  44.92 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  42.67 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  44.5 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0018  band 7 protein  44.64 
 
 		 251 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  42.74 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  42.74 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  42.74 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  41.35 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>