More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2175 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  100 
 
 		 366 aa  748    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  62.38 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  59.2 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  59.2 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  58.13 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  53.98 
 
 		 349 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  58.13 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  51.42 
 
 		 340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  53.77 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  52.32 
 
 		 347 aa  332  8e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  47.48 
 
 		 341 aa  332  8e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  50.77 
 
 		 355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  48.24 
 
 		 341 aa  315  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  48.77 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  46.39 
 
 		 355 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  49.84 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  51.24 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  45 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  48.76 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  44.04 
 
 		 347 aa  295  8e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  47.52 
 
 		 347 aa  291  9e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  46.63 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  46.2 
 
 		 351 aa  288  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  45.34 
 
 		 336 aa  286  4e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  44.98 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  47.26 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  45.15 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  43.08 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  45.6 
 
 		 353 aa  282  8.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  44.68 
 
 		 352 aa  281  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  43.38 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  45.35 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  45.45 
 
 		 351 aa  279  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  44.62 
 
 		 348 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  44.65 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  44.41 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  42.81 
 
 		 335 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  43.23 
 
 		 339 aa  270  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  44.21 
 
 		 349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  44.72 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  43.9 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  43.48 
 
 		 342 aa  266  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  39.5 
 
 		 334 aa  265  8e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  42.9 
 
 		 341 aa  263  4.999999999999999e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.87 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  43.29 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  42.28 
 
 		 335 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  42.68 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  40.56 
 
 		 335 aa  258  8e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.24 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  42.01 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  36.62 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  41.51 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  41.8 
 
 		 332 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  41.12 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  42.99 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 337 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 		 349 aa  242  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  41.18 
 
 		 332 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 345 aa  242  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  41.1 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  41.07 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0774  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  39.47 
 
 		 341 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  39.18 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  39.63 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  42.77 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  37.7 
 
 		 336 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  42.46 
 
 		 347 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  40.57 
 
 		 338 aa  234  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  40.57 
 
 		 380 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  41.85 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  40.74 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  39.63 
 
 		 333 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  41.54 
 
 		 347 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 		 336 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  41.54 
 
 		 347 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.06 
 
 		 336 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  38.12 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  39.88 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.39 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  39.2 
 
 		 338 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  38.7 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  42.15 
 
 		 347 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  41.93 
 
 		 345 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  38.39 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.33 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.33 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  42.33 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.33 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.33 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.33 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  42.02 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  41.8 
 
 		 354 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  38.39 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  38.94 
 
 		 338 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>