30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0540 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  315  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  47.06 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  46.38 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  46.38 
 
 		 140 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  42.03 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  41.04 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  32.89 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  30.3 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  33.33 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  36.3 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  30.65 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  29.31 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  34.17 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  25.9 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4198  hypothetical protein  36.78 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  27.78 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  33.1 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  25.18 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  27.59 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  35.97 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  25.53 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  30.5 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  29.55 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  29.41 
 
 		 131 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  26.96 
 
 		 141 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  26.96 
 
 		 141 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  25.36 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  28.06 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>