45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1154 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  638    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  56.13 
 
 
325 aa  347  1e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  46.28 
 
 
352 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  44.29 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  38.64 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  37.63 
 
 
336 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  38.13 
 
 
313 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  36.45 
 
 
315 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  36.3 
 
 
314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  35.67 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  31.2 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  28.68 
 
 
334 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  31.74 
 
 
349 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  31.47 
 
 
349 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  27.65 
 
 
348 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  29.31 
 
 
356 aa  99.4  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  30.83 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  26.84 
 
 
350 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 
321 aa  89  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  30.92 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  26.67 
 
 
296 aa  79  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  25 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  28.24 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  27.68 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  24.6 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  25.88 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  27.83 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  25.1 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  31.77 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  28.96 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  27.31 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  27.08 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  26.26 
 
 
371 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1431  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.14 
 
 
219 aa  52.8  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.22 
 
 
558 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.06 
 
 
555 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  30.7 
 
 
208 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2184  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.24 
 
 
233 aa  46.2  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  36.76 
 
 
1320 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  31.71 
 
 
198 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0330  uridine kinase-like  24.18 
 
 
240 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0269818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  31.71 
 
 
198 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  30 
 
 
210 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1167  hypothetical protein  25.76 
 
 
238 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  36.08 
 
 
207 aa  42.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>