46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2389 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2389  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0303  hypothetical protein  80.1 
 
 
191 aa  315  3e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26581  hypothetical protein  65.56 
 
 
213 aa  237  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01531  hypothetical protein  50.57 
 
 
194 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1458  hypothetical protein  47.68 
 
 
188 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0910474  normal  0.0228469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1821  hypothetical protein  44.06 
 
 
191 aa  120  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441586  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1957  protein of unknown function DUF218  38.89 
 
 
200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1984  protein of unknown function DUF218  38.89 
 
 
200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000111651  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3813  protein of unknown function DUF218  43.66 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2734  hypothetical protein  38.71 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3502  hypothetical protein  40.69 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.420517  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4922  hypothetical protein  32.17 
 
 
198 aa  88.2  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354834  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2404  hypothetical protein  32.68 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0266202  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3327  protein of unknown function DUF218  29.79 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0930  protein of unknown function DUF218  30.94 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0298  hypothetical protein  37.96 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1037  hypothetical protein  31.21 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.689799  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3881  protein of unknown function DUF218  35.29 
 
 
232 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.912065  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3831  protein of unknown function DUF218  35.29 
 
 
232 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2992  hypothetical protein  35.92 
 
 
232 aa  59.3  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.575665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  34.01 
 
 
252 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  38.46 
 
 
262 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  31.03 
 
 
266 aa  52  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  30.72 
 
 
271 aa  51.2  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  32.95 
 
 
255 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  25.69 
 
 
242 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  39.33 
 
 
253 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  34.78 
 
 
256 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  35.87 
 
 
256 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  30.91 
 
 
256 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
215 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  37.08 
 
 
259 aa  44.7  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  27.22 
 
 
259 aa  44.7  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  27.64 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  34.88 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  27.22 
 
 
264 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  34.78 
 
 
253 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  27.69 
 
 
245 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  32.61 
 
 
256 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  26.38 
 
 
266 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  26.38 
 
 
264 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  31 
 
 
262 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  37.08 
 
 
253 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  37.08 
 
 
253 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  35.42 
 
 
251 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  36.92 
 
 
206 aa  41.2  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>