91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2050 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2050  biotin biosynthesis  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.146243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0622  biotin biosynthesis protein BioC  55.51 
 
 		 254 aa  274  8e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18701  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.8 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1001  SAM dependent methyltransferase  41.8 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04571  methylase  44.08 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15901  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.06 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16501  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.53 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.286767  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16601  methylase  25.2 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.203041  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1563  biotin synthesis protein BioC, putative  24.8 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.8 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  31.17 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  31.28 
 
 		 474 aa  75.5  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  24.27 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  27.43 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  36.6 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.36 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  28.8 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.68 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.28 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  24.88 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.54 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  24.88 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.1 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  32.9 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  35.29 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.18 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  27.2 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.78 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  31.29 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  30 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.45 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.7 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1660  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  36.47 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  24.23 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  23.93 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  23.5 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  23.5 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  23.5 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  23.5 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  23.5 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.27 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  21.96 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  20.65 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  27.59 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.18 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  23.5 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  29.5 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  27.86 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.65 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  26.79 
 
 		 325 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  36.77 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  26.79 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  32 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.82 
 
 		 312 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  29.25 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  29.25 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  29.25 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.02 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  37.62 
 
 		 344 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.33 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  31.78 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  23.45 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  24.05 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.07 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.02 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.29 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.99 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.29 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.96 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.72 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.96 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.02 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.97 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  24.07 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  35 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.32 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.29 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.29 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  31.41 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  26.19 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  29.29 
 
 		 333 aa  42  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  25.93 
 
 		 284 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>