More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0804 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  100 
 
 
445 aa  874    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  73.7 
 
 
445 aa  618  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  68.65 
 
 
450 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  57.21 
 
 
432 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  54.38 
 
 
438 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  53.93 
 
 
448 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  45.5 
 
 
438 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  45.5 
 
 
438 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  45.5 
 
 
438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  43.98 
 
 
437 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  45.19 
 
 
449 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  44.27 
 
 
446 aa  368  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  46.09 
 
 
443 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  43.78 
 
 
451 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  43.85 
 
 
451 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  45.04 
 
 
452 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  45.76 
 
 
451 aa  344  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  42.25 
 
 
443 aa  343  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  39.78 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  37.95 
 
 
452 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  39.73 
 
 
452 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  39.33 
 
 
464 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  38.63 
 
 
452 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  36.61 
 
 
448 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  38.98 
 
 
448 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  35.9 
 
 
448 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  36.36 
 
 
453 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  35.46 
 
 
448 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  33.63 
 
 
462 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  32.67 
 
 
444 aa  249  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  38.98 
 
 
451 aa  249  9e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  38.17 
 
 
449 aa  249  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  35.81 
 
 
452 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  37.62 
 
 
444 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  35.92 
 
 
468 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  34.57 
 
 
445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  35.48 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  30.59 
 
 
455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  37.33 
 
 
457 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  33.85 
 
 
444 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  33.41 
 
 
444 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  34.07 
 
 
444 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  34.07 
 
 
444 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  34.07 
 
 
444 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  34.07 
 
 
444 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  33.85 
 
 
444 aa  229  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  33.85 
 
 
444 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  33.85 
 
 
444 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  32.21 
 
 
456 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  33.18 
 
 
449 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  33.63 
 
 
444 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  33.85 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  34.93 
 
 
453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  35.68 
 
 
451 aa  223  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  37.35 
 
 
447 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  29.21 
 
 
428 aa  221  3e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  33.66 
 
 
444 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  29.95 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  29.18 
 
 
435 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  29.18 
 
 
435 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  28.79 
 
 
442 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  28.57 
 
 
442 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  33.62 
 
 
471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  32.1 
 
 
440 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  38 
 
 
436 aa  212  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.4 
 
 
429 aa  210  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  36.1 
 
 
440 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  34.87 
 
 
449 aa  207  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  31.68 
 
 
430 aa  206  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  31.45 
 
 
448 aa  205  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  34.51 
 
 
451 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  32.52 
 
 
449 aa  200  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  36.56 
 
 
434 aa  200  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  35.03 
 
 
452 aa  199  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  40.22 
 
 
434 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  29.89 
 
 
424 aa  196  7e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  35.82 
 
 
453 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  34.87 
 
 
427 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.2 
 
 
442 aa  194  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  40 
 
 
434 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  34.84 
 
 
429 aa  193  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  34.84 
 
 
429 aa  193  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  34.38 
 
 
436 aa  192  9e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  28.57 
 
 
453 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  37.28 
 
 
501 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  34.62 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  35.78 
 
 
429 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  35.68 
 
 
429 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.38 
 
 
427 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  35.68 
 
 
429 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.58 
 
 
462 aa  189  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0021  sun protein  37.24 
 
 
434 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  35.07 
 
 
439 aa  189  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0022  sun protein  37.24 
 
 
431 aa  189  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.242982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  35.44 
 
 
429 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  36.43 
 
 
431 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.95 
 
 
444 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  35.19 
 
 
429 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  34.78 
 
 
427 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  35.19 
 
 
429 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>