89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4078 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  257  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  81.89 
 
 		 127 aa  215  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  79.53 
 
 		 127 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  80.95 
 
 		 127 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  79.53 
 
 		 127 aa  207  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  78.74 
 
 		 127 aa  206  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  77.95 
 
 		 127 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  77.17 
 
 		 127 aa  200  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  77.17 
 
 		 127 aa  200  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  76.38 
 
 		 127 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  77.17 
 
 		 127 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  76.38 
 
 		 127 aa  197  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  72.44 
 
 		 127 aa  194  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  67.72 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  71.05 
 
 		 128 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  70.91 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  58.2 
 
 		 128 aa  151  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  58.2 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  56 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  43.7 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  44.83 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  39.02 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0756  hypothetical protein  48.33 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  41.59 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  41.59 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  41.59 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  41.59 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  37.4 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  36.59 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1928  transmembrane protein  37.1 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0661  hypothetical protein  36.29 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0752  hypothetical protein  36.29 
 
 		 243 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2042  hypothetical protein  36.29 
 
 		 243 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  34.96 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0321  membrane protein-like protein  40.94 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0441228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  37.4 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  36 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  34.4 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  34.38 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0294  membrane protein-like protein  40.16 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  35.2 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  36.44 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  37.4 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  36.94 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  35.54 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  36.72 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  36.59 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0831  transmembrane protein  35.66 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  32 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  35.94 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  32.8 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02203  hypothetical protein  32.58 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  33.94 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0816  hypothetical protein  37.82 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0927  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4798  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467764 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  32.81 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  31.62 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  33.02 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  29.37 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  33.02 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  35 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1027  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00407266  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3416  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0380  hypothetical protein  32.74 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  33.64 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11071  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11061  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  28.87 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  28.87 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4900  membrane protein-like protein  36.08 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2325  membrane protein-like protein  36.73 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  32.63 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  29.03 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  30.4 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  30 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11021  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  36.26 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2347  membrane protein-like protein  32.5 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2308  hypothetical protein  31.03 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2531  hypothetical protein  32.98 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247104  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1510  membrane protein-like protein  32.5 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  28.42 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  28.57 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0651  hypothetical protein  28.28 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  30.83 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  25.98 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  25.81 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2005  hypothetical protein  31.03 
 
 		 141 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>