34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3647 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  100 
 
 		 121 aa  244  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  79.34 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  66.39 
 
 		 120 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  67.23 
 
 		 120 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  67.23 
 
 		 120 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  67.23 
 
 		 120 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  65.55 
 
 		 120 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  63.87 
 
 		 120 aa  158  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  63.87 
 
 		 119 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  63.87 
 
 		 120 aa  158  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  64.46 
 
 		 126 aa  156  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  61.98 
 
 		 142 aa  157  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  63.03 
 
 		 120 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  64.86 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  61.54 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  53.39 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  37.1 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1096  hypothetical protein  28.32 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.622776  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  43.96 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  45.45 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  31.15 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3036  VanZ family protein  36.71 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000617485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  29.76 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19790  hypothetical protein  32.18 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  41.18 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1976  VanZ family protein  28.97 
 
 		 134 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.999512  normal  0.218225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3020  hypothetical protein  26.6 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0145  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  35.63 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  34.29 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3200  hypothetical protein  32.56 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  0.73098 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  28.92 
 
 		 165 aa  40.4  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  35.71 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  40.98 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>