More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1776 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
213 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.65 
 
 
211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.22 
 
 
205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.5 
 
 
205 aa  230  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51 
 
 
206 aa  214  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.26 
 
 
206 aa  210  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.26 
 
 
203 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.74 
 
 
206 aa  207  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.49 
 
 
206 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.78 
 
 
214 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48 
 
 
202 aa  202  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
202 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.27 
 
 
206 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.5 
 
 
202 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.5 
 
 
218 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.36 
 
 
217 aa  194  8.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.5 
 
 
225 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.48 
 
 
208 aa  192  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.53 
 
 
225 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.08 
 
 
225 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.94 
 
 
205 aa  189  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.95 
 
 
204 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.44 
 
 
204 aa  188  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.23 
 
 
200 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2448  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.92 
 
 
222 aa  185  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.05 
 
 
224 aa  185  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.41 
 
 
227 aa  185  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877023 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.9 
 
 
210 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.91 
 
 
213 aa  185  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.57 
 
 
223 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.77 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.94 
 
 
223 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.22 
 
 
224 aa  181  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2769  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.57 
 
 
227 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.95 
 
 
194 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1531  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52 
 
 
197 aa  178  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2513  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.63 
 
 
230 aa  177  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.3 
 
 
225 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0564  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.21 
 
 
218 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513649  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.55 
 
 
220 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.39 
 
 
220 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0791  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.73 
 
 
220 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277928  normal  0.560587 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.86 
 
 
209 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.779009  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.28 
 
 
195 aa  175  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.28 
 
 
195 aa  174  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.53 
 
 
205 aa  174  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.07 
 
 
222 aa  174  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.21 
 
 
313 aa  174  8e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.91 
 
 
215 aa  174  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.28 
 
 
195 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.74 
 
 
195 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.06 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.74 
 
 
195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.74 
 
 
195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.74 
 
 
195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.74 
 
 
195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1486  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.47 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000112239  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.67 
 
 
195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.74 
 
 
195 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.22 
 
 
212 aa  171  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4633  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.74 
 
 
239 aa  171  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.2 
 
 
195 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2538  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.92 
 
 
206 aa  169  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1967  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.5 
 
 
236 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.94 
 
 
224 aa  168  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.39 
 
 
210 aa  168  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.88 
 
 
229 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.86 
 
 
213 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.4 
 
 
220 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1129  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.7 
 
 
214 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.27 
 
 
209 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.84 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1102  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.7 
 
 
214 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.31 
 
 
212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1456  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.95 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.551821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.78 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1281  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.89 
 
 
195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0253  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.93 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1407  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.21 
 
 
202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.15 
 
 
205 aa  161  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1114  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.51 
 
 
191 aa  161  6e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.660024 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.15 
 
 
205 aa  161  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39 
 
 
217 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.81 
 
 
221 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.57 
 
 
212 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.88 
 
 
205 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234419  normal  0.638022 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45 
 
 
230 aa  159  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0394188  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0383  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.21 
 
 
202 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.2 
 
 
218 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28120  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.8 
 
 
228 aa  158  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.69 
 
 
220 aa  158  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5165  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.5 
 
 
218 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820799  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.31 
 
 
214 aa  158  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.49 
 
 
250 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.165078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.25 
 
 
219 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.44 
 
 
212 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0641  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.23 
 
 
208 aa  157  2e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.25 
 
 
219 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.23 
 
 
216 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>