34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1665 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  51.41 
 
 
281 aa  278  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  43.2 
 
 
257 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  40.86 
 
 
277 aa  192  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  43.08 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21160  hypothetical protein  39.09 
 
 
254 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04820  hypothetical protein  38.68 
 
 
256 aa  165  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.62014  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  31.09 
 
 
249 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  31.09 
 
 
249 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  33.6 
 
 
257 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  31.3 
 
 
330 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  33.74 
 
 
321 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  32.91 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  35.32 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  33.06 
 
 
249 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  35.1 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  31.39 
 
 
247 aa  106  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  26.01 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2014  hypothetical protein  24.81 
 
 
298 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.765055  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  34.13 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  26.05 
 
 
271 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  26.95 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  55.1  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  25.86 
 
 
289 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  32.06 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  31.18 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  22.99 
 
 
275 aa  48.9  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  44.44 
 
 
255 aa  48.5  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  26.64 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  29.01 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  22.01 
 
 
286 aa  45.8  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  23.27 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>