35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4255 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4255  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 630 aa  1257    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0761  Pyrrolo-quinoline quinone  27.46 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  26.44 
 
 		 2122 aa  60.8  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  27.09 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1682 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2927  hypothetical protein  25.93 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3265  Pyrrolo-quinoline quinone  24.14 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  24.3 
 
 		 322 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  27.31 
 
 		 322 aa  55.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2094  Pyrrolo-quinoline quinone  24.43 
 
 		 429 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  26.64 
 
 		 463 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  26.57 
 
 		 322 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  22.94 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.91 
 
 		 380 aa  50.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 795 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4265  Pyrrolo-quinoline quinone  25.39 
 
 		 429 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  25.07 
 
 		 486 aa  49.7  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.85 
 
 		 1383 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 687 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  32.79 
 
 		 546 aa  48.9  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 		 963 aa  48.5  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  24.63 
 
 		 447 aa  47.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.48 
 
 		 386 aa  47.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13051  hypothetical protein  27.24 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.102461 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  28.67 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  28.07 
 
 		 809 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  38.46 
 
 		 573 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.46 
 
 		 573 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  38.46 
 
 		 573 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 		 431 aa  45.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  23.57 
 
 		 469 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  36.76 
 
 		 457 aa  44.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  28.46 
 
 		 653 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  33.71 
 
 		 395 aa  43.9  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  25.38 
 
 		 412 aa  43.9  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>