35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0761 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0761  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 421 aa  870    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4265  Pyrrolo-quinoline quinone  30.32 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1910  Pyrrolo-quinoline quinone  30.54 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1863  hypothetical protein  30.54 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3265  Pyrrolo-quinoline quinone  28.88 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1844  Pyrrolo-quinoline quinone  30.07 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2094  Pyrrolo-quinoline quinone  27.89 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13051  hypothetical protein  27.25 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.102461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2927  hypothetical protein  27.18 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4255  Pyrrolo-quinoline quinone  27.46 
 
 		 630 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  26.3 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  27.98 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.75 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  24.38 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  23.77 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.36 
 
 		 2122 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.14 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  23.34 
 
 		 797 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  22.49 
 
 		 687 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  24.9 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  29.37 
 
 		 469 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  23.29 
 
 		 416 aa  46.6  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  24.4 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  21.99 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1323  Pyrrolo-quinoline quinone  25.07 
 
 		 639 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  22.84 
 
 		 809 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  27.08 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  26.49 
 
 		 1328 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  27.89 
 
 		 1969 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  27.89 
 
 		 2036 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  29.89 
 
 		 1454 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 820 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  27.52 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  23.32 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  21.19 
 
 		 2272 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>