15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1863 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1863  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  842    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1910  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
427 aa  842    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1844  Pyrrolo-quinoline quinone  99.3 
 
 
427 aa  837    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2094  Pyrrolo-quinoline quinone  71 
 
 
429 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4265  Pyrrolo-quinoline quinone  70.16 
 
 
429 aa  609  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494797  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13051  hypothetical protein  63.36 
 
 
360 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.102461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2927  hypothetical protein  33.64 
 
 
444 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3265  Pyrrolo-quinoline quinone  34.35 
 
 
447 aa  216  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0761  Pyrrolo-quinoline quinone  30.54 
 
 
421 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4255  Pyrrolo-quinoline quinone  25.84 
 
 
630 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  27.54 
 
 
322 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  26.9 
 
 
352 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  25.15 
 
 
322 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  24.69 
 
 
322 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  34.57 
 
 
1682 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>