19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4265 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2094  Pyrrolo-quinoline quinone  79.95 
 
 
429 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4265  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
429 aa  851    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494797  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1844  Pyrrolo-quinoline quinone  70.86 
 
 
427 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1910  Pyrrolo-quinoline quinone  70.16 
 
 
427 aa  594  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1863  hypothetical protein  70.16 
 
 
427 aa  594  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13051  hypothetical protein  61.71 
 
 
360 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.102461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2927  hypothetical protein  34.19 
 
 
444 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3265  Pyrrolo-quinoline quinone  32.71 
 
 
447 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0761  Pyrrolo-quinoline quinone  30.32 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  35.59 
 
 
322 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4255  Pyrrolo-quinoline quinone  25.39 
 
 
630 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  34.82 
 
 
322 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  31.73 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  24.42 
 
 
352 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  33.9 
 
 
322 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  42.86 
 
 
463 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  30.81 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  27.91 
 
 
484 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.36 
 
 
380 aa  43.5  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>