More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3544 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3544  methyltransferase type 11  100 
 
 		 247 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.51858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0468  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1982  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 260 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  51.85 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1055  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  32.9 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1826  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00341289  normal  0.127097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.21 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2086  methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0379374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2069  methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0598804  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2132  methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0115408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.48 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.19 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  49.02 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  46.3 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  32.56 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  31.73 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2971  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  54.72 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  33.86 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  32.67 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  31.73 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  43.01 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  30.07 
 
 		 658 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  36.13 
 
 		 204 aa  52  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.73 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  47.06 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.78 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.9 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  52.17 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  33.02 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.36 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  37.18 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  44 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0557  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.76 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46747  predicted protein  38.71 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 355 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  39.29 
 
 		 282 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 337 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.13 
 
 		 276 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10531  methyltransferase  36.84 
 
 		 116 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 282 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.46 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.1 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  46.43 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18440  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.534553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.3 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.78 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  23.94 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.99 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  44.44 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.77 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.5 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1285  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  40.82 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.06 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>