More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3071 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3071  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  29.71 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2865  glutathione S-transferase-like  27.13 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0706359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1905  glutathione S-transferase family protein  25.5 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2873  glutathione S-transferase-like  23.91 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.480428  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.49 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1668  glutathione S-transferase family protein  26.1 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.15 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  40.48 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.14 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  27.45 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  45.31 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.45 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  26.09 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.67 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  27.72 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  27.91 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  27.31 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  26.99 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  45.31 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  27.63 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  42.31 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  45.33 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  26.64 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  42.31 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  26.36 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.61 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.45 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.04 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  27.18 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  28.57 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.36 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  47.22 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  41.03 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  26.97 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  25.49 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  26.47 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1740  Glutathione S-transferase domain protein  39.19 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  29.2 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.01 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.25 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  42.86 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.28 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  27.39 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2048  maleylacetoacetate isomerase  27.62 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  45.83 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  24.35 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.06 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  28.44 
 
 		 203 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2091  glutathione S-transferase-like  25.91 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00729429  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  24 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.47 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  27.49 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  39.08 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  46.15 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  41.46 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50200  maleylacetoacetate isomerase  38.36 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.43 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0872  glutathione S-transferase-like  36.92 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.64 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  39.36 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  41.43 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  42.31 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03149  maleylacetoacetate isomerase  26.54 
 
 		 220 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  33.98 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  42.03 
 
 		 217 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  40.96 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  45.07 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.97 
 
 		 206 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  37.66 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  36.36 
 
 		 212 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.41 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4182  glutathione S-transferase-like protein  22.08 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.645028  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.79 
 
 		 225 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.89 
 
 		 213 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  23.4 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  34.15 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  37 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  24.44 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.62 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  25.63 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  35.62 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1699  glutathione S-transferase family protein  22.8 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2348  glutathione S-transferase-like protein  41.1 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2831  maleylacetoacetate isomerase  41.18 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1050  glutathione S-transferase  24.89 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.087398  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  25.65 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  24.55 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  26.36 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  27.43 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.32 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.57 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  24.32 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  27.57 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  23.04 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.02 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  34.62 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  27.1 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  30.77 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>