More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27200 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
249 aa  497  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  65.71 
 
 
238 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.2 
 
 
243 aa  268  7e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  59.68 
 
 
251 aa  262  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.6 
 
 
240 aa  254  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.66 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.13 
 
 
244 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  56.4 
 
 
244 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  57.2 
 
 
253 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  53.17 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.17 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.6 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.78 
 
 
263 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  53.2 
 
 
262 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.6 
 
 
236 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  57.77 
 
 
248 aa  237  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.33 
 
 
252 aa  229  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.38 
 
 
243 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.17 
 
 
248 aa  215  7e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.33 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  45.99 
 
 
1314 aa  211  9e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.84 
 
 
252 aa  209  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.51 
 
 
246 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.57 
 
 
313 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  42.17 
 
 
1055 aa  201  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.26 
 
 
258 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.7 
 
 
1051 aa  198  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.84 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  44.35 
 
 
1053 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.74 
 
 
1052 aa  195  7e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  47.93 
 
 
260 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.32 
 
 
1053 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.84 
 
 
250 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.58 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  45.31 
 
 
1088 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.45 
 
 
525 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.76 
 
 
1051 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.26 
 
 
1050 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.26 
 
 
252 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.07 
 
 
1053 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.47 
 
 
1125 aa  152  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  37.19 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.1 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.44 
 
 
242 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  32.72 
 
 
1327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  28.99 
 
 
214 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.8 
 
 
245 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  35.55 
 
 
218 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  33.18 
 
 
221 aa  95.9  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  33.2 
 
 
248 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  33.02 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  32.69 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  32.26 
 
 
219 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.21 
 
 
216 aa  93.6  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.04 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.97 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.56 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.39 
 
 
456 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  29.22 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  29.96 
 
 
215 aa  87  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  32.6 
 
 
208 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  28.98 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  27.87 
 
 
220 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.54 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  28.16 
 
 
456 aa  82.4  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.1 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  31.92 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.96 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  28.16 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  31.55 
 
 
978 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  29.71 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  30.73 
 
 
965 aa  79.7  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  27.09 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.22 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  29.47 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  29.47 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  29.47 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  29.47 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  32.32 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  30.81 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.35 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  29.06 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  29.06 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  29.06 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  31.46 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  27.06 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
219 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.83 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  28.15 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.8 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>